RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PDE4D-204ENST00000358923 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.06■■□□□ 1.6
PDE4D-204ENST00000358923 PLA2R1Q13018 1463 aa25.02■■□□□ 1.6
PDE4D-204ENST00000358923 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.01■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 FAM69CQ0P6D2 419 aa25■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 GGT6Q6P531 493 aa24.99■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.98■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 PLXNC1O60486 1568 aa24.97■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.96■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.96■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 ATP7AQ04656 1500 aa24.95■■□□□ 1.59
PDE4D-204ENST00000358923 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.95■■□□□ 1.58
PDE4D-204ENST00000358923 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PDE4D-204ENST00000358923 ERBINQ96RT1 1412 aa24.93■■□□□ 1.58
PDE4D-204ENST00000358923 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.93■■□□□ 1.58
PDE4D-204ENST00000358923 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.9■■□□□ 1.58
PDE4D-204ENST00000358923 UNC13BO14795 1591 aa24.9■■□□□ 1.58
PDE4D-204ENST00000358923 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.88■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 USP47Q96K76 1375 aa24.87■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 ANP32CO43423 234 aa24.86■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.86■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.85■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.84■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.83■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.83■■□□□ 1.57
PDE4D-204ENST00000358923 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.83■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.82■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 TSPOAP1O95153 1857 aa24.81■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC7Q96M83 1385 aa24.81■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 A2MP01023 1474 aa24.8■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.8■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.79■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC184Q52MB2 194 aa24.78■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.77■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 E9PCH4 1651 aa24.77■■□□□ 1.56
PDE4D-204ENST00000358923 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
PDE4D-204ENST00000358923 KANK1Q14678 1352 aa24.75■■□□□ 1.55
PDE4D-204ENST00000358923 ATP10AO60312 1499 aa24.75■■□□□ 1.55
PDE4D-204ENST00000358923 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.74■■□□□ 1.55
PDE4D-204ENST00000358923 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.72■■□□□ 1.55
PDE4D-204ENST00000358923 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.71■■□□□ 1.55
PDE4D-204ENST00000358923 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.71■■□□□ 1.55
PDE4D-204ENST00000358923 MLECQ14165 292 aa24.7■■□□□ 1.55
PDE4D-204ENST00000358923 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.7■■□□□ 1.54
PDE4D-204ENST00000358923 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.7■■□□□ 1.54
PDE4D-204ENST00000358923 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.7■■□□□ 1.54
PDE4D-204ENST00000358923 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.67■■□□□ 1.54
PDE4D-204ENST00000358923 ABCA6Q8N139 1617 aa24.67■■□□□ 1.54
PDE4D-204ENST00000358923 KDM5CP41229 1560 aa24.65■■□□□ 1.54
PDE4D-204ENST00000358923 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.64■■□□□ 1.54
PDE4D-204ENST00000358923 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.64■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 NEO1Q92859 1461 aa24.63■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 CLTCL1P53675 1640 aa24.63■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 DEPDC5O75140 1603 aa24.63■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.63■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.62■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 CEP152O94986 1710 aa24.62■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.61■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 DIP2BQ9P265 1576 aa24.6■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.6■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 PTPRTO14522 1441 aa24.59■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 NPATQ14207 1427 aa24.59■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PDE4D-204ENST00000358923 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.58■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 TET3O43151 1660 aa24.57■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.56■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.56■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 TRPM2O94759 1503 aa24.56■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.56■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.54■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 RICTORQ6R327 1708 aa24.53■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.53■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 CCER2I3L3R5 266 aa24.53■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.52■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 TESK2Q96S53 571 aa24.52■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.52■■□□□ 1.52
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.51■■□□□ 1.51
PDE4D-204ENST00000358923 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
PDE4D-204ENST00000358923 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PDE4D-204ENST00000358923 MRS2Q9HD23 443 aa24.49■■□□□ 1.51
PDE4D-204ENST00000358923 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.48■■□□□ 1.51
PDE4D-204ENST00000358923 IDI1Q13907 227 aa24.48■■□□□ 1.51
PDE4D-204ENST00000358923 GLI2P10070 1586 aa24.47■■□□□ 1.51
PDE4D-204ENST00000358923 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
PDE4D-204ENST00000358923 BCANQ96GW7 911 aa24.46■■□□□ 1.51
PDE4D-204ENST00000358923 ABCC3O15438 1527 aa24.46■■□□□ 1.51
PDE4D-204ENST00000358923 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
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