RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 APAF1O14727 1248 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.89■□□□□ 0.78
PTPRU-201ENST00000345512 GSE1Q14687 1217 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 HECW1Q76N89 1606 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 ROCK1Q13464 1354 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 GRIN2BQ13224 1484 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 BACH2Q9BYV9 841 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 KIF3BO15066 747 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 CUL7Q14999 1698 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 ABCC5O15440 1437 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
PTPRU-201ENST00000345512 COG6Q9Y2V7 657 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 GOLGA6L22H0YM25 854 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 PTPRGP23470 1445 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 E9PSI1 815 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 HSCBQ8IWL3 235 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 POGKQ9P215 609 aa19.8■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 NFKBIBQ15653 356 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 GGT6Q6P531 493 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRU-201ENST00000345512 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.75■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 SKAP1Q86WV1 359 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 STK26Q9P289 416 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 PPP2R1AP30153 589 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.74■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 IL27Q8NEV9 243 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 IQGAP2Q13576 1575 aa19.73■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.72■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.71■□□□□ 0.75
PTPRU-201ENST00000345512 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 PANK1Q8TE04 598 aa19.68■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.67■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.66■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 BCAR3O75815 825 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.65■□□□□ 0.74
PTPRU-201ENST00000345512 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 CASC1Q6TDU7 716 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 NGEFQ8N5V2 710 aa19.63■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 ERBINQ96RT1 1412 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.61■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.6■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 GBP4Q96PP9 640 aa19.59■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
PTPRU-201ENST00000345512 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 RUNDC1Q96C34 613 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 IFT140Q96RY7 1462 aa19.58■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 APBB1O00213 710 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 AFAP1Q8N556 730 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 STAC3Q96MF2 364 aa19.57■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 SYNJ2O15056 1496 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 TPRNQ4KMQ1 711 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.56■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 ARHGEF11O15085 1522 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.55■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
PTPRU-201ENST00000345512 TCP11L2Q8N4U5 519 aa19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.7 ms