RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.39■■□□□ 1.17
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SHQ1-201ENST00000325599 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-201ENST00000325599 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.34■■□□□ 1.17
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SHQ1-201ENST00000325599 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.31■■□□□ 1.16
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SHQ1-201ENST00000325599 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-201ENST00000325599 PLA2R1Q13018 1463 aa22.3■■□□□ 1.16
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SHQ1-201ENST00000325599 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-201ENST00000325599 UNC13BO14795 1591 aa22.27■■□□□ 1.16
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SHQ1-201ENST00000325599 TMC1Q8TDI8 760 aa22.23■■□□□ 1.15
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SHQ1-201ENST00000325599 A2MP01023 1474 aa22.21■■□□□ 1.15
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SHQ1-201ENST00000325599 PLCH2O75038 1416 aa22.2■■□□□ 1.14
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SHQ1-201ENST00000325599 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.18■■□□□ 1.14
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SHQ1-201ENST00000325599 ABCC1P33527 1531 aa22.12■■□□□ 1.13
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SHQ1-201ENST00000325599 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.12■■□□□ 1.13
SHQ1-201ENST00000325599 TESK2Q96S53 571 aa22.11■■□□□ 1.13
SHQ1-201ENST00000325599 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.1■■□□□ 1.13
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SHQ1-201ENST00000325599 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SHQ1-201ENST00000325599 ATP10AO60312 1499 aa22.08■■□□□ 1.12
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SHQ1-201ENST00000325599 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.96■■□□□ 1.11
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SHQ1-201ENST00000325599 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.92■■□□□ 1.1
SHQ1-201ENST00000325599 TRPM2O94759 1503 aa21.92■■□□□ 1.1
SHQ1-201ENST00000325599 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.92■■□□□ 1.1
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SHQ1-201ENST00000325599 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.83■■□□□ 1.09
SHQ1-201ENST00000325599 ASXL2Q76L83 1435 aa21.82■■□□□ 1.08
SHQ1-201ENST00000325599 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.81■■□□□ 1.08
SHQ1-201ENST00000325599 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SHQ1-201ENST00000325599 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.81■■□□□ 1.08
SHQ1-201ENST00000325599 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.8■■□□□ 1.08
SHQ1-201ENST00000325599 PDE3BQ13370 1112 aa21.79■■□□□ 1.08
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