RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.52■□□□□ 0.56
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PTPRN-201ENST00000295718 SLC24A1O60721 1099 aa18.5■□□□□ 0.55
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PTPRN-201ENST00000295718 CDCA8Q53HL2 280 aa18.5■□□□□ 0.55
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PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.47■□□□□ 0.55
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PTPRN-201ENST00000295718 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.46■□□□□ 0.54
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PTPRN-201ENST00000295718 E9PSI1 815 aa18.35■□□□□ 0.53
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PTPRN-201ENST00000295718 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
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PTPRN-201ENST00000295718 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
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PTPRN-201ENST00000295718 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.24■□□□□ 0.51
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PTPRN-201ENST00000295718 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRN-201ENST00000295718 ROCK1Q13464 1354 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRN-201ENST00000295718 TRAK2O60296 914 aa18.24■□□□□ 0.51
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PTPRN-201ENST00000295718 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.23■□□□□ 0.51
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PTPRN-201ENST00000295718 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRN-201ENST00000295718 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRN-201ENST00000295718 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRN-201ENST00000295718 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRN-201ENST00000295718 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRN-201ENST00000295718 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRN-201ENST00000295718 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRN-201ENST00000295718 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRN-201ENST00000295718 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRN-201ENST00000295718 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRN-201ENST00000295718 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.19■□□□□ 0.5
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