RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 TSPY10P0CW01 314 aa23.28■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 NBR1Q14596 966 aa23.27■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 ATP10BO94823 1461 aa23.27■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PDE4A-201ENST00000293683 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.25■■□□□ 1.31
PDE4A-201ENST00000293683 ABCA8O94911 1581 aa23.24■■□□□ 1.31
PDE4A-201ENST00000293683 E9PCH4 1651 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE4A-201ENST00000293683 PTPRGP23470 1445 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE4A-201ENST00000293683 RALBP1Q15311 655 aa23.23■■□□□ 1.31
PDE4A-201ENST00000293683 NUP160Q12769 1436 aa23.21■■□□□ 1.31
PDE4A-201ENST00000293683 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PDE4A-201ENST00000293683 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.21■■□□□ 1.31
PDE4A-201ENST00000293683 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PDE4A-201ENST00000293683 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.2■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 RGL3Q3MIN7 710 aa23.2■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.17■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.16■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 NLRP13Q86W25 1043 aa23.15■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.15■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.15■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.14■■□□□ 1.3
PDE4A-201ENST00000293683 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.13■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.12■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.12■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.12■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.11■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.1■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.09■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 PLA2R1Q13018 1463 aa23.09■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.08■■□□□ 1.29
PDE4A-201ENST00000293683 A2MP01023 1474 aa23.07■■□□□ 1.28
PDE4A-201ENST00000293683 PLIN1O60240 522 aa23.07■■□□□ 1.28
PDE4A-201ENST00000293683 TESK2Q96S53 571 aa23.05■■□□□ 1.28
PDE4A-201ENST00000293683 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PDE4A-201ENST00000293683 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.04■■□□□ 1.28
PDE4A-201ENST00000293683 SKAP1Q86WV1 359 aa23.03■■□□□ 1.28
PDE4A-201ENST00000293683 PREX2Q70Z35 1606 aa23.03■■□□□ 1.28
PDE4A-201ENST00000293683 PANK3Q9H999 370 aa23.02■■□□□ 1.28
PDE4A-201ENST00000293683 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.02■■□□□ 1.28
PDE4A-201ENST00000293683 PDE3BQ13370 1112 aa23.01■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 PDE4AP27815 886 aa23■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 ERBINQ96RT1 1412 aa22.98■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.97■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.96■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 UNC13BO14795 1591 aa22.96■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.96■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.95■■□□□ 1.27
PDE4A-201ENST00000293683 CRBNQ96SW2 442 aa22.95■■□□□ 1.26
PDE4A-201ENST00000293683 BACH2Q9BYV9 841 aa22.94■■□□□ 1.26
PDE4A-201ENST00000293683 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.93■■□□□ 1.26
PDE4A-201ENST00000293683 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PDE4A-201ENST00000293683 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.92■■□□□ 1.26
PDE4A-201ENST00000293683 TMF1P82094 1093 aa22.91■■□□□ 1.26
PDE4A-201ENST00000293683 LAMC1P11047 1609 aa22.91■■□□□ 1.26
PDE4A-201ENST00000293683 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.9■■□□□ 1.26
PDE4A-201ENST00000293683 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PDE4A-201ENST00000293683 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.9■■□□□ 1.26
PDE4A-201ENST00000293683 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.89■■□□□ 1.25
PDE4A-201ENST00000293683 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.256e-7■■■■□ 19.9
PDE4A-201ENST00000293683 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.88■■□□□ 1.25
PDE4A-201ENST00000293683 MS4A1P11836 297 aa22.87■■□□□ 1.25
PDE4A-201ENST00000293683 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.86■■□□□ 1.25
PDE4A-201ENST00000293683 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.86■■□□□ 1.25
PDE4A-201ENST00000293683 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PDE4A-201ENST00000293683 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.83■■□□□ 1.25
PDE4A-201ENST00000293683 PLXNC1O60486 1568 aa22.83■■□□□ 1.25
PDE4A-201ENST00000293683 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.83■■□□□ 1.24
PDE4A-201ENST00000293683 INSRP06213 1382 aa22.82■■□□□ 1.24
PDE4A-201ENST00000293683 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PDE4A-201ENST00000293683 PPP2R1AP30153 589 aa22.81■■□□□ 1.24
PDE4A-201ENST00000293683 ATP10AO60312 1499 aa22.8■■□□□ 1.24
PDE4A-201ENST00000293683 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.79■■□□□ 1.24
PDE4A-201ENST00000293683 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.79■■□□□ 1.24
PDE4A-201ENST00000293683 NEFMP07197 916 aa22.78■■□□□ 1.24
PDE4A-201ENST00000293683 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.77■■□□□ 1.24
PDE4A-201ENST00000293683 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PDE4A-201ENST00000293683 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
PDE4A-201ENST00000293683 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.76■■□□□ 1.23
PDE4A-201ENST00000293683 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.75■■□□□ 1.23
PDE4A-201ENST00000293683 MADDQ8WXG6 1647 aa22.74■■□□□ 1.23
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF521Q96K83 1311 aa22.72■■□□□ 1.23
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.72■■□□□ 1.23
PDE4A-201ENST00000293683 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.71■■□□□ 1.23
PDE4A-201ENST00000293683 IQGAP1P46940 1657 aa22.71■■□□□ 1.23
PDE4A-201ENST00000293683 CHD1O14646 1710 aa22.71■■□□□ 1.23
PDE4A-201ENST00000293683 SLC4A3P48751 1232 aa22.7■■□□□ 1.22
PDE4A-201ENST00000293683 GOLGA2Q08379 1002 aa22.69■■□□□ 1.22
PDE4A-201ENST00000293683 ABCC2Q92887 1545 aa22.68■■□□□ 1.22
PDE4A-201ENST00000293683 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
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