RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CNOT11-201ENST00000289382 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.05■■□□□ 1.6
CNOT11-201ENST00000289382 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.05■■□□□ 1.6
CNOT11-201ENST00000289382 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.05■■□□□ 1.6
CNOT11-201ENST00000289382 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CNOT11-201ENST00000289382 PDE4AP27815 886 aa25.02■■□□□ 1.6
CNOT11-201ENST00000289382 TMC1Q8TDI8 760 aa25.02■■□□□ 1.6
CNOT11-201ENST00000289382 ABCA8O94911 1581 aa25.02■■□□□ 1.6
CNOT11-201ENST00000289382 TSPY4P0CV99 314 aa25.01■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 TSPY10P0CW01 314 aa25.01■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.01■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 DCAF11Q8TEB1 546 aa25■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.99■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.98■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 BACH2Q9BYV9 841 aa24.98■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 KDM5CP41229 1560 aa24.98■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 KIF15Q9NS87 1388 aa24.97■■□□□ 1.59
CNOT11-201ENST00000289382 MS4A1P11836 297 aa24.92■■□□□ 1.58
CNOT11-201ENST00000289382 RGL3Q3MIN7 710 aa24.92■■□□□ 1.58
CNOT11-201ENST00000289382 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CNOT11-201ENST00000289382 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.91■■□□□ 1.58
CNOT11-201ENST00000289382 PTPRGP23470 1445 aa24.9■■□□□ 1.58
CNOT11-201ENST00000289382 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.584e-7■■■■□ 22.7
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CNOT11-201ENST00000289382 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.88■■□□□ 1.57
CNOT11-201ENST00000289382 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.88■■□□□ 1.57
CNOT11-201ENST00000289382 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.87■■□□□ 1.57
CNOT11-201ENST00000289382 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.86■■□□□ 1.57
CNOT11-201ENST00000289382 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CNOT11-201ENST00000289382 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.86■■□□□ 1.57
CNOT11-201ENST00000289382 GSE1Q14687 1217 aa24.85■■□□□ 1.57
CNOT11-201ENST00000289382 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.85■■□□□ 1.57
CNOT11-201ENST00000289382 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CNOT11-201ENST00000289382 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.83■■□□□ 1.57
CNOT11-201ENST00000289382 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CNOT11-201ENST00000289382 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.82■■□□□ 1.56
CNOT11-201ENST00000289382 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.82■■□□□ 1.56
CNOT11-201ENST00000289382 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.79■■□□□ 1.56
CNOT11-201ENST00000289382 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.79■■□□□ 1.56
CNOT11-201ENST00000289382 NFKBIBQ15653 356 aa24.78■■□□□ 1.56
CNOT11-201ENST00000289382 RALBP1Q15311 655 aa24.77■■□□□ 1.56
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.77■■□□□ 1.56
CNOT11-201ENST00000289382 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.76■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.76■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.75■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 PLA2R1Q13018 1463 aa24.74■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 SKAP1Q86WV1 359 aa24.74■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.74■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.73■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.73■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 PLIN1O60240 522 aa24.71■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.71■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 PREX2Q70Z35 1606 aa24.71■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CNOT11-201ENST00000289382 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.7■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.69■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.69■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 SLC4A3P48751 1232 aa24.69■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 PDE3BQ13370 1112 aa24.69■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 NLRP13Q86W25 1043 aa24.68■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 CHD1O14646 1710 aa24.66■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 E9PCH4 1651 aa24.65■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 A2MP01023 1474 aa24.65■■□□□ 1.54
CNOT11-201ENST00000289382 CRBNQ96SW2 442 aa24.64■■□□□ 1.53
CNOT11-201ENST00000289382 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.64■■□□□ 1.53
CNOT11-201ENST00000289382 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CNOT11-201ENST00000289382 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CNOT11-201ENST00000289382 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.63■■□□□ 1.53
CNOT11-201ENST00000289382 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.63■■□□□ 1.53
CNOT11-201ENST00000289382 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.61■■□□□ 1.53
CNOT11-201ENST00000289382 TESK2Q96S53 571 aa24.61■■□□□ 1.53
CNOT11-201ENST00000289382 PANK3Q9H999 370 aa24.57■■□□□ 1.52
CNOT11-201ENST00000289382 UNC13BO14795 1591 aa24.54■■□□□ 1.52
CNOT11-201ENST00000289382 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.53■■□□□ 1.52
CNOT11-201ENST00000289382 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CNOT11-201ENST00000289382 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.53■■□□□ 1.52
CNOT11-201ENST00000289382 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.51■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 AFAP1Q8N556 730 aa24.5■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.5■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.5■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.5■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.5■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 FAM161AQ3B820 660 aa24.49■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 C8orf34Q49A92 452 aa24.49■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.49■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 ABCC2Q92887 1545 aa24.49■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 ERBINQ96RT1 1412 aa24.47■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 SHROOM2Q13796 1616 aa24.47■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.47■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CNOT11-201ENST00000289382 PLXNC1O60486 1568 aa24.43■■□□□ 1.5
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