RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 KDM5CP41229 1560 aa24.52■■□□□ 1.52
PANX1-201ENST00000227638 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.52■■□□□ 1.52
PANX1-201ENST00000227638 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
PANX1-201ENST00000227638 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.49■■□□□ 1.51
PANX1-201ENST00000227638 PREX2Q70Z35 1606 aa24.49■■□□□ 1.51
PANX1-201ENST00000227638 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.48■■□□□ 1.51
PANX1-201ENST00000227638 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.46■■□□□ 1.51
PANX1-201ENST00000227638 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.46■■□□□ 1.51
PANX1-201ENST00000227638 SHROOM2Q13796 1616 aa24.45■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.45■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 SKAP1Q86WV1 359 aa24.43■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.43■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 ABCC2Q92887 1545 aa24.43■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.42■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.41■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.41■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.4■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.4■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 PLIN1O60240 522 aa24.4■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.39■■□□□ 1.5
PANX1-201ENST00000227638 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.38■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.37■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.37■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.37■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 PLA2R1Q13018 1463 aa24.37■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 PANK3Q9H999 370 aa24.37■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 AFAP1Q8N556 730 aa24.35■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 NBR1Q14596 966 aa24.34■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.33■■□□□ 1.49
PANX1-201ENST00000227638 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.31■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 TESK2Q96S53 571 aa24.31■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.31■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.3■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.29■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 RALBP1Q15311 655 aa24.29■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 A2MP01023 1474 aa24.28■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 PLCH2O75038 1416 aa24.27■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.27■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.27■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PANX1-201ENST00000227638 NLRP13Q86W25 1043 aa24.26■■□□□ 1.47
PANX1-201ENST00000227638 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PANX1-201ENST00000227638 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.26■■□□□ 1.47
PANX1-201ENST00000227638 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PANX1-201ENST00000227638 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.2■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.2■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 UNC13BO14795 1591 aa24.19■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.18■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.18■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.17■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 PLXNC1O60486 1568 aa24.16■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 ABCC1P33527 1531 aa24.15■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 ERBINQ96RT1 1412 aa24.14■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 TMF1P82094 1093 aa24.14■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.13■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.13■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.12■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.12■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 CRBNQ96SW2 442 aa24.11■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 KIF3BO15066 747 aa24.08■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 E9PCH4 1651 aa24.06■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.06■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.05■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.05■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 FANCAO15360 1455 aa24.04■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.04■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.04■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 PPP2R1AP30153 589 aa24.03■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.02■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.02■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 PDE4AP27815 886 aa24■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 ASXL2Q76L83 1435 aa23.98■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 ATP10AO60312 1499 aa23.97■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 ADGRL1O94910 1474 aa23.97■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms