RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 KDM5CP41229 1560 aa24.52■■□□□ 1.52
PANX1-201ENST00000227638 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.52■■□□□ 1.52
PANX1-201ENST00000227638 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
PANX1-201ENST00000227638 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.49■■□□□ 1.51
PANX1-201ENST00000227638 PREX2Q70Z35 1606 aa24.49■■□□□ 1.51
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PANX1-201ENST00000227638 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.46■■□□□ 1.51
PANX1-201ENST00000227638 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.46■■□□□ 1.51
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PANX1-201ENST00000227638 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.4■■□□□ 1.5
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PANX1-201ENST00000227638 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.33■■□□□ 1.49
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PANX1-201ENST00000227638 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.3■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.29■■□□□ 1.48
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PANX1-201ENST00000227638 PLCH2O75038 1416 aa24.27■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.27■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.27■■□□□ 1.48
PANX1-201ENST00000227638 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PANX1-201ENST00000227638 NLRP13Q86W25 1043 aa24.26■■□□□ 1.47
PANX1-201ENST00000227638 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
PANX1-201ENST00000227638 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.26■■□□□ 1.47
PANX1-201ENST00000227638 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PANX1-201ENST00000227638 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
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PANX1-201ENST00000227638 UNC13BO14795 1591 aa24.19■■□□□ 1.46
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PANX1-201ENST00000227638 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.18■■□□□ 1.46
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PANX1-201ENST00000227638 ERBINQ96RT1 1412 aa24.14■■□□□ 1.46
PANX1-201ENST00000227638 TMF1P82094 1093 aa24.14■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.13■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.13■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.12■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.12■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 CRBNQ96SW2 442 aa24.11■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 KIF3BO15066 747 aa24.08■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PANX1-201ENST00000227638 E9PCH4 1651 aa24.06■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.06■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.05■■□□□ 1.44
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PANX1-201ENST00000227638 FANCAO15360 1455 aa24.04■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.04■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.04■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
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PANX1-201ENST00000227638 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.02■■□□□ 1.44
PANX1-201ENST00000227638 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
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PANX1-201ENST00000227638 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 PDE4AP27815 886 aa24■■□□□ 1.43
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PANX1-201ENST00000227638 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 ASXL2Q76L83 1435 aa23.98■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 ATP10AO60312 1499 aa23.97■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 ADGRL1O94910 1474 aa23.97■■□□□ 1.43
PANX1-201ENST00000227638 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
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