RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.27■■■■□ 3.4
FAM149A-201ENST00000227065 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
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FAM149A-201ENST00000227065 RALBP1Q15311 655 aa36.24■■■■□ 3.39
FAM149A-201ENST00000227065 SYNJ2O15056 1496 aa36.24■■■■□ 3.39
FAM149A-201ENST00000227065 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.23■■■■□ 3.39
FAM149A-201ENST00000227065 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.23■■■■□ 3.39
FAM149A-201ENST00000227065 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
FAM149A-201ENST00000227065 EXOC6Q8TAG9 804 aa36.2■■■■□ 3.39
FAM149A-201ENST00000227065 ATP10BO94823 1461 aa36.19■■■■□ 3.38
FAM149A-201ENST00000227065 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.18■■■■□ 3.38
FAM149A-201ENST00000227065 RRP1P56182 461 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
FAM149A-201ENST00000227065 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
FAM149A-201ENST00000227065 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
FAM149A-201ENST00000227065 PTPRGP23470 1445 aa36.13■■■■□ 3.37
FAM149A-201ENST00000227065 ABCA8O94911 1581 aa36.11■■■■□ 3.37
FAM149A-201ENST00000227065 NUP160Q12769 1436 aa36.11■■■■□ 3.37
FAM149A-201ENST00000227065 RCAN3Q9UKA8 241 aa36.1■■■■□ 3.37
FAM149A-201ENST00000227065 RGL3Q3MIN7 710 aa36.09■■■■□ 3.37
FAM149A-201ENST00000227065 E9PCH4 1651 aa36.08■■■■□ 3.37
FAM149A-201ENST00000227065 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
FAM149A-201ENST00000227065 NLRP13Q86W25 1043 aa36.08■■■■□ 3.37
FAM149A-201ENST00000227065 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.07■■■■□ 3.36
FAM149A-201ENST00000227065 ERCC6Q03468 1493 aa36.04■■■■□ 3.36
FAM149A-201ENST00000227065 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.02■■■■□ 3.36
FAM149A-201ENST00000227065 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.02■■■■□ 3.36
FAM149A-201ENST00000227065 CDCA7LQ96GN5 454 aa36.01■■■■□ 3.35
FAM149A-201ENST00000227065 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.01■■■■□ 3.35
FAM149A-201ENST00000227065 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.99■■■■□ 3.35
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.99■■■■□ 3.35
FAM149A-201ENST00000227065 PDE4AP27815 886 aa35.96■■■■□ 3.35
FAM149A-201ENST00000227065 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.96■■■■□ 3.35
FAM149A-201ENST00000227065 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.96■■■■□ 3.35
FAM149A-201ENST00000227065 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
FAM149A-201ENST00000227065 PDE3BQ13370 1112 aa35.94■■■■□ 3.34
FAM149A-201ENST00000227065 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.94■■■■□ 3.34
FAM149A-201ENST00000227065 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
FAM149A-201ENST00000227065 PLIN1O60240 522 aa35.94■■■■□ 3.34
FAM149A-201ENST00000227065 SKAP1Q86WV1 359 aa35.92■■■■□ 3.34
FAM149A-201ENST00000227065 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
FAM149A-201ENST00000227065 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.91■■■■□ 3.34
FAM149A-201ENST00000227065 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.88■■■■□ 3.33
FAM149A-201ENST00000227065 PLA2R1Q13018 1463 aa35.87■■■■□ 3.33
FAM149A-201ENST00000227065 TESK2Q96S53 571 aa35.86■■■■□ 3.33
FAM149A-201ENST00000227065 BACH2Q9BYV9 841 aa35.86■■■■□ 3.33
FAM149A-201ENST00000227065 PANK3Q9H999 370 aa35.86■■■■□ 3.33
FAM149A-201ENST00000227065 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.86■■■■□ 3.33
FAM149A-201ENST00000227065 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.85■■■■□ 3.33
FAM149A-201ENST00000227065 A2MP01023 1474 aa35.85■■■■□ 3.33
FAM149A-201ENST00000227065 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.83■■■■□ 3.33
FAM149A-201ENST00000227065 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
FAM149A-201ENST00000227065 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.78■■■■□ 3.32
FAM149A-201ENST00000227065 PREX2Q70Z35 1606 aa35.78■■■■□ 3.32
FAM149A-201ENST00000227065 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.77■■■■□ 3.32
FAM149A-201ENST00000227065 NEFMP07197 916 aa35.77■■■■□ 3.32
FAM149A-201ENST00000227065 CRBNQ96SW2 442 aa35.77■■■■□ 3.32
FAM149A-201ENST00000227065 ERBINQ96RT1 1412 aa35.75■■■■□ 3.31
FAM149A-201ENST00000227065 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
FAM149A-201ENST00000227065 MS4A1P11836 297 aa35.73■■■■□ 3.31
FAM149A-201ENST00000227065 TMF1P82094 1093 aa35.73■■■■□ 3.31
FAM149A-201ENST00000227065 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
FAM149A-201ENST00000227065 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.7■■■■□ 3.31
FAM149A-201ENST00000227065 UNC13BO14795 1591 aa35.7■■■■□ 3.31
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.69■■■■□ 3.3
FAM149A-201ENST00000227065 C20orf194Q5TEA3 1177 aa35.67■■■■□ 3.3
FAM149A-201ENST00000227065 LAMC1P11047 1609 aa35.65■■■■□ 3.3
FAM149A-201ENST00000227065 IL27Q8NEV9 243 aa35.65■■■■□ 3.3
FAM149A-201ENST00000227065 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.65■■■■□ 3.3
FAM149A-201ENST00000227065 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.65■■■■□ 3.3
FAM149A-201ENST00000227065 INSRP06213 1382 aa35.62■■■■□ 3.29
FAM149A-201ENST00000227065 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.62■■■■□ 3.29
FAM149A-201ENST00000227065 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.61■■■■□ 3.29
FAM149A-201ENST00000227065 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.6■■■■□ 3.29
FAM149A-201ENST00000227065 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
FAM149A-201ENST00000227065 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.29
FAM149A-201ENST00000227065 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.57■■■■□ 3.28
FAM149A-201ENST00000227065 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
FAM149A-201ENST00000227065 SLC4A3P48751 1232 aa35.52■■■■□ 3.28
FAM149A-201ENST00000227065 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.52■■■■□ 3.28
FAM149A-201ENST00000227065 USP35Q9P2H5 1018 aa35.51■■■■□ 3.28
FAM149A-201ENST00000227065 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.51■■■■□ 3.28
FAM149A-201ENST00000227065 PPP2R1AP30153 589 aa35.51■■■■□ 3.27
FAM149A-201ENST00000227065 ATP10AO60312 1499 aa35.51■■■■□ 3.27
FAM149A-201ENST00000227065 PLXNC1O60486 1568 aa35.51■■■■□ 3.27
FAM149A-201ENST00000227065 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
FAM149A-201ENST00000227065 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.48■■■■□ 3.27
FAM149A-201ENST00000227065 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.48■■■■□ 3.27
FAM149A-201ENST00000227065 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.48■■■■□ 3.27
FAM149A-201ENST00000227065 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.48■■■■□ 3.27
FAM149A-201ENST00000227065 DUSP27Q5VZP5 1158 aa35.45■■■■□ 3.27
FAM149A-201ENST00000227065 KDM2BQ8NHM5 1336 aa35.44■■■■□ 3.26
FAM149A-201ENST00000227065 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
FAM149A-201ENST00000227065 DDRGK1Q96HY6 314 aa35.43■■■■□ 3.26
FAM149A-201ENST00000227065 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
FAM149A-201ENST00000227065 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
FAM149A-201ENST00000227065 GOLGA2Q08379 1002 aa35.37■■■■□ 3.25
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF521Q96K83 1311 aa35.35■■■■□ 3.25
FAM149A-201ENST00000227065 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
FAM149A-201ENST00000227065 NFKBIBQ15653 356 aa35.32■■■■□ 3.24
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