RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216420.11

CGRRF1-201, Transcript of cell growth regulator with ring finger domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CGRRF1, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1-201ENST00000216420 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.03■■□□□ 1.44
CGRRF1-201ENST00000216420 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
CGRRF1-201ENST00000216420 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.03■■□□□ 1.44
CGRRF1-201ENST00000216420 PLIN1O60240 522 aa24.03■■□□□ 1.44
CGRRF1-201ENST00000216420 WDR62O43379 1518 aa24■■□□□ 1.43
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CGRRF1-201ENST00000216420 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.96■■□□□ 1.43
CGRRF1-201ENST00000216420 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
CGRRF1-201ENST00000216420 ADGRL2O95490 1459 aa23.94■■□□□ 1.42
CGRRF1-201ENST00000216420 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.94■■□□□ 1.42
CGRRF1-201ENST00000216420 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
CGRRF1-201ENST00000216420 POGKQ9P215 609 aa23.93■■□□□ 1.42
CGRRF1-201ENST00000216420 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.91■■□□□ 1.42
CGRRF1-201ENST00000216420 CLCN1P35523 988 aa23.91■■□□□ 1.42
CGRRF1-201ENST00000216420 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.89■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 USP19O94966 1318 aa23.89■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.89■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 CEP170Q5SW79 1584 aa23.88■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 ZMYND15Q9H091 742 aa23.87■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.86■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.86■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 BECN1Q14457 450 aa23.85■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 FSD2A1L4K1 749 aa23.85■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.83■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CGRRF1-201ENST00000216420 PKD2Q13563 968 aa23.82■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.82■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 LAMC1P11047 1609 aa23.82■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 IQGAP2Q13576 1575 aa23.82■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.82■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 NLRP1Q9C000 1473 aa23.81■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.81■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.8■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.8■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF521Q96K83 1311 aa23.79■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.78■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CGRRF1-201ENST00000216420 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CGRRF1-201ENST00000216420 ZMYM3Q14202 1370 aa23.76■■□□□ 1.39
CGRRF1-201ENST00000216420 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.75■■□□□ 1.39
CGRRF1-201ENST00000216420 RGS3P49796 1198 aa23.75■■□□□ 1.39
CGRRF1-201ENST00000216420 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.73■■□□□ 1.39
CGRRF1-201ENST00000216420 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.73■■□□□ 1.39
CGRRF1-201ENST00000216420 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.73■■□□□ 1.39
CGRRF1-201ENST00000216420 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.72■■□□□ 1.39
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.71■■□□□ 1.39
CGRRF1-201ENST00000216420 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.39
CGRRF1-201ENST00000216420 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.7■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 PTPRGP23470 1445 aa23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 GOLGA2Q08379 1002 aa23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.67■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 MRE11P49959 708 aa23.66■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 SLFN5Q08AF3 891 aa23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CGRRF1-201ENST00000216420 MCM4P33991 863 aa23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 SEC24BO95487 1268 aa23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.62■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 TBC1D32Q96NH3 1257 aa23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.61■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 TPM2P07951 284 aa23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 PANK2Q9BZ23 570 aa23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 NUP155O75694 1391 aa23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 PLXNC1O60486 1568 aa23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 IGHDP01880 384 aa23.6■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 PBRM1Q86U86 1689 aa23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 TESK2Q96S53 571 aa23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.59■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 PDE3AQ14432 1141 aa23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 ABCC2Q92887 1545 aa23.58■■□□□ 1.37
CGRRF1-201ENST00000216420 PANK3Q9H999 370 aa23.58■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 ERBINQ96RT1 1412 aa23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 ESPNB1AK53 854 aa23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 ADAMTS12P58397 1594 aa23.57■■□□□ 1.36
CGRRF1-201ENST00000216420 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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