RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000206074.1

Hddc3-206, Transcript of Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

TSL 2 BASIC

Gene Hddc3, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Talpid3E9PV87 1520 aa22.63■■□□□ 1.21
Hddc3-206ENSMUST00000206074 NclP09405 707 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Abca6Q8K441 1624 aa22.63■■□□□ 1.21
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Myom2Q14BI5 1463 aa22.61■■□□□ 1.21
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Rfx7F8VPJ6 1459 aa22.6■■□□□ 1.21
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Trpm2Q91YD4 1506 aa22.59■■□□□ 1.21
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Cyb5rlB1AS42 316 aa22.59■■□□□ 1.21
Hddc3-206ENSMUST00000206074 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Naip5Q9R016 1403 aa22.56■■□□□ 1.2
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Vps8Q0P5W1 1427 aa22.55■■□□□ 1.2
Hddc3-206ENSMUST00000206074 ShprhQ7TPQ3 1674 aa22.54■■□□□ 1.2
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Rsph4aQ8BYM7 716 aa22.53■■□□□ 1.2
Hddc3-206ENSMUST00000206074 RictorQ6QI06 1708 aa22.53■■□□□ 1.2
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Myo5cE9Q1F5 1742 aa22.52■■□□□ 1.2
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Mia2Q91ZV0 1396 aa22.5■■□□□ 1.19
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Pde4cQ3UEI1 686 aa22.49■■□□□ 1.19
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Dip2bQ3UH60 1574 aa22.48■■□□□ 1.19
Hddc3-206ENSMUST00000206074 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa22.47■■□□□ 1.19
Hddc3-206ENSMUST00000206074 AlkP97793 1621 aa22.47■■□□□ 1.19
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Knl1Q66JQ7 1612 aa22.47■■□□□ 1.19
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Zfp644E9QA22 1323 aa22.45■■□□□ 1.18
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Prex1Q69ZK0 1650 aa22.45■■□□□ 1.18
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa22.44■■□□□ 1.18
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ube2uB1AUC4 352 aa22.42■■□□□ 1.18
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Map4P27546 1125 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Clstn2Q9ER65 966 aa22.42■■□□□ 1.18
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa22.41■■□□□ 1.18
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Fhad1A6PWD2 1420 aa22.41■■□□□ 1.18
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Gm13697A2AK42 830 aa22.4■■□□□ 1.18
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Topaz1E5FYH1 1653 aa22.38■■□□□ 1.17
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Adamts7Q68SA9 1657 aa22.36■■□□□ 1.17
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Asxl1P59598 1514 aa22.36■■□□□ 1.17
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Hfm1D3Z4R1 1434 aa22.35■■□□□ 1.17
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Bcl9Q9D219 1425 aa22.33■■□□□ 1.17
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Robo2Q7TPD3 1470 aa22.32■■□□□ 1.16
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ttll5Q8CHB8 1328 aa22.31■■□□□ 1.16
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Abcc6Q9R1S7 1498 aa22.31■■□□□ 1.16
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ttc21bQ0HA38 1315 aa22.3■■□□□ 1.16
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa22.29■■□□□ 1.16
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Akap12Q9WTQ5 1684 aa22.27■■□□□ 1.16
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Myom3A2ABU4 1439 aa22.26■■□□□ 1.15
Hddc3-206ENSMUST00000206074 AnkarA2RT91 1465 aa22.26■■□□□ 1.15
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Scn4aQ9ER60 1841 aa22.25■■□□□ 1.15
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Nsd2Q8BVE8 1365 aa22.25■■□□□ 1.15
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Cd109Q8R422 1442 aa22.24■■□□□ 1.15
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Dip2aQ8BWT5 1523 aa22.23■■□□□ 1.15
Hddc3-206ENSMUST00000206074 PtprgQ05909 1442 aa22.22■■□□□ 1.15
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Trak1Q6PD31 939 aa22.21■■□□□ 1.15
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa22.21■■□□□ 1.15
Hddc3-206ENSMUST00000206074 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Mphosph9A6H5Y1 991 aa22.16■■□□□ 1.14
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Erich6D3Z6S9 713 aa22.15■■□□□ 1.14
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ino80Q6ZPV2 1559 aa22.15■■□□□ 1.14
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Skint5A7XUY5 1461 aa22.12■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Atp7aQ64430 1491 aa22.12■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Iqgap3F8VQ29 1632 aa22.12■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa22.12■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Kif13aQ9EQW7 1749 aa22.11■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Mier1Q5UAK0 511 aa22.1■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Pip4k2bQ80XI4 416 aa22.1■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Kif21bQ9QXL1 1668 aa22.1■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Tarbp1E9Q368 1579 aa22.09■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa22.09■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Tecpr2Q3UH45 1423 aa22.08■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ccer2J3QPU5 274 aa22.08■■□□□ 1.13
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ncoa1P70365 1447 aa22.07■■□□□ 1.12
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Efcab6Q6P1E8 1516 aa22.07■■□□□ 1.12
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa22.07■■□□□ 1.12
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa22.07■■□□□ 1.12
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Stk24Q99KH8 431 aa22.06■■□□□ 1.12
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa22.04■■□□□ 1.12
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Rims2Q9EQZ7 1530 aa22.01■■□□□ 1.11
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Uggt1Q6P5E4 1551 aa22.01■■□□□ 1.11
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Naip7Q9JIB3 1402 aa22.01■■□□□ 1.11
Hddc3-206ENSMUST00000206074 ErbinQ80TH2 1402 aa22■■□□□ 1.11
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Pkd2O35245 966 aa22■■□□□ 1.11
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Txndc2Q6P902 515 aa21.98■■□□□ 1.11
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Sall3Q62255 1320 aa21.98■■□□□ 1.11
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Pik3c2gO70167 1506 aa21.97■■□□□ 1.11
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Abca8aQ8K442 1620 aa21.97■■□□□ 1.11
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa21.95■■□□□ 1.1
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Mroh1E0CZ22 1640 aa21.93■■□□□ 1.1
Hddc3-206ENSMUST00000206074 P3h3Q8CG70 732 aa21.93■■□□□ 1.1
Hddc3-206ENSMUST00000206074 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13 ms