RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP21,87■■□□□ 1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP21,86■■□□□ 1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pde3bQ61409 1100 aa21,86■■□□□ 1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP21,86■■□□□ 1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP21,86■■□□□ 1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tsen2Q6P7W5 460 aa21,85■■□□□ 1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plekhh2Q8C115 1491 aa21,85■■□□□ 1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fyco1Q8VDC1 1437 aa21,85■■□□□ 1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dmrt2Q8BG36 561 aa21,85■■□□□ 1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP21,85■■□□□ 1,09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bcl2l13P59017 434 aa21,82■■□□□ 1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 MycnP03966 462 aaKnown RBP21,81■■□□□ 1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP21,81■■□□□ 1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP21,81■■□□□ 1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Usp40Q8BWR4 1235 aa21,8■■□□□ 1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ArsiQ32KI9 573 aa21,78■■□□□ 1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zscan21Q07231 555 aa21,78■■□□□ 1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Krt82Q99M74 516 aa21,78■■□□□ 1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP21,77■■□□□ 1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smc4Q8CG47 1286 aa21,77■■□□□ 1,08
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fmn1Q05860 1466 aa21,77■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc146E9Q9F7 977 aa21,76■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tpd52l1O54818 204 aa21,76■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Erich6bQ9D4S6 220 aa21,76■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 BccipQ9CWI3 316 aa21,75■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21,74■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 WrnO09053 1401 aa21,74■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chmp5Q9D7S9 219 aa21,73■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm10471E9Q1C7 252 aa21,73■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Neurod6P48986 337 aa21,73■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arhgap35Q91YM2 1499 aa21,72■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cep162Q6ZQ06 1403 aa21,72■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP21,71■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccp110Q7TSH4 1004 aa21,71■■□□□ 1,07
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zranb3Q6NZP1 1069 aa21,7■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccer1Q9CQL2 403 aa21,69■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plagl1Q9JLQ4 704 aa21,69■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa21,69■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm973E9Q295 1059 aa21,69■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pank3Q8R2W9 370 aa21,69■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttll5Q8CHB8 1328 aa21,69■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 R3hcc1Q8BSI6 488 aa21,69■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q9D9H8 365 aa21,68■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm21969J3QJZ1 289 aa21,68■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccnb3Q810T2 1396 aa21,68■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam71e1A1L3C1 212 aa21,67■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP21,67■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc60Q8C4J0 545 aa21,66■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ripply1Q2WG77 201 aa21,65■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP21,65■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 TatQ8QZR1 454 aa21,65■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddx11Q6AXC6 880 aa21,65■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CntlnA2AM05 1397 aa21,65■■□□□ 1,06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa21,64■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc96Q9CR92 584 aa21,63■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP21,63■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 CrcpO35427 148 aa21,62■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Jph4Q80WT0 628 aa21,62■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wdr78E9PYY5 807 aa21,62■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Znf704Q9ERQ3 566 aa21,61■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Abl1P00520 1123 aa21,61■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 AcrbpQ3V140 540 aa21,61■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Supt16hQ920B9 1047 aa21,61■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kif7B7ZNG0 1348 aa21,6■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP21,6■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Inpp5dQ9ES52 1191 aa21,59■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP21,59■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8C5K5 320 aa21,59■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP21,59■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP21,58■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa21,58■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa21,58■■□□□ 1,05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adam1bQ8R534 806 aa21,58■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tdrd9Q14BI7 1383 aa21,57■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 FosbP13346 338 aa21,57■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tceal9Q9DD24 104 aa21,57■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm21698A0A087WQP8 267 aa21,57■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm21671G3UY31 267 aa21,57■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP21,56■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccdc27Q3V036 639 aa21,56■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Stard8Q8K031 1019 aa21,56■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP21,55■■□□□ 1,04
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gsto1O09131 240 aa21,55■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 EspnQ9ET47 871 aa21,54■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa21,54■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Chmp4cQ9D7F7 232 aa21,53■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GsdmaQ9EST1 446 aa21,53■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP21,53■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Afap1Q80YS6 731 aa21,52■■□□□ 1,04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ell2Q3UKU1 639 aa21,51■■□□□ 1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa21,51■■□□□ 1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Carmil1Q6EDY6 1374 aa21,51■■□□□ 1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sycp2Q9CUU3 1500 aa21,5■■□□□ 1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hs1bp3Q3TC93 395 aa21,5■■□□□ 1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NexnQ7TPW1 607 aa21,49■■□□□ 1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Triml2E9PW10 424 aa21,49■■□□□ 1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP21,49■■□□□ 1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP21,49■■□□□ 1,03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Usp16Q99LG0 825 aa21,49■■□□□ 1,03
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