RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tsen2Q6P7W5 460 aa21.85■■□□□ 1.09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Plekhh2Q8C115 1491 aa21.85■■□□□ 1.09
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fyco1Q8VDC1 1437 aa21.85■■□□□ 1.09
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zscan21Q07231 555 aa21.78■■□□□ 1.08
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pank3Q8R2W9 370 aa21.69■■□□□ 1.06
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ttll5Q8CHB8 1328 aa21.69■■□□□ 1.06
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Supt16hQ920B9 1047 aa21.61■■□□□ 1.05
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8C5K5 320 aa21.59■■□□□ 1.05
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Adam1bQ8R534 806 aa21.58■■□□□ 1.04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tdrd9Q14BI7 1383 aa21.57■■□□□ 1.04
Ptprf-201ENSMUST00000049074 FosbP13346 338 aa21.57■■□□□ 1.04
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm21671G3UY31 267 aa21.57■■□□□ 1.04
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 EspnQ9ET47 871 aa21.54■■□□□ 1.04
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa21.51■■□□□ 1.03
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Ptprf-201ENSMUST00000049074 Sycp2Q9CUU3 1500 aa21.5■■□□□ 1.03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Hs1bp3Q3TC93 395 aa21.5■■□□□ 1.03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NexnQ7TPW1 607 aa21.49■■□□□ 1.03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Triml2E9PW10 424 aa21.49■■□□□ 1.03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Usp16Q99LG0 825 aa21.49■■□□□ 1.03
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