RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046095.9

Vsx1-201, Transcript of Visual system homeobox 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vsx1, Length 3,791 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Srcin1Q9QWI6 1250 aa16.15■□□□□ 0.18
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Erbb3Q61526 1339 aa16.15■□□□□ 0.18
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.18
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mug1P28665 1476 aa16.14■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dnttip2Q8R2M2 758 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plcb2A3KGF7 1181 aa16.13■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kif16bB1AVY7 1312 aa16.13■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pank1Q8K4K6 548 aa16.12■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Soga1E1U8D0 1418 aa16.12■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Golga2Q921M4 999 aa16.12■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Znf330Q922H9 316 aa16.11■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Camsap2Q8C1B1 1461 aa16.11■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Htatsf1Q8BGC0 757 aa16.1■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Erich3F6QRE9 1637 aa16.1■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Crocc2F6XLV1 1638 aa16.09■□□□□ 0.17
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ccdc30Q8BVF4 654 aa16.08■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gpatch8A2A6A1 1505 aa16.07■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tspyl2Q7TQI8 677 aa16.07■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mre11Q61216 706 aa16.07■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 SynmQ70IV5 1561 aa16.06■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Znf692Q3U381 531 aa16.06■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Taok2Q6ZQ29 1240 aa16.06■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 BC005561E9Q5E2 1589 aa16.05■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa16.05■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fam184bQ0KK56 942 aa16.05■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kif7B7ZNG0 1348 aa16.05■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fan1Q69ZT1 1020 aa16.04■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kank1E9Q238 1360 aa16.04■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa16.03■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Myom3A2ABU4 1439 aa16.03■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Samd9lQ69Z37 1561 aa16.03■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ksr2Q3UVC0 959 aa16.03■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PrxO55103 1391 aa16.03■□□□□ 0.16
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa16.02■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 AU015836B2RUM3 263 aa16.02■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa16.01■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ccdc183A2AJB1 534 aa16■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ncoa3O09000 1398 aa16■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pik3c2gO70167 1506 aa16■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 AknaQ80VW7 1404 aa15.99■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Stag3O70576 1240 aa15.99■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa15.98■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Trim44Q9QXA7 346 aa15.96■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pknox2Q8BG99 474 aa15.96■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Il16O54824 1322 aa15.96■□□□□ 0.15
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mug2P28666 1451 aa15.95■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 GorabQ8BRM2 368 aa15.95■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nkx1-2P42580 305 aa15.95■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa15.95■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmco5bQ80X59 307 aa15.95■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ipo4Q8VI75 1082 aa15.94■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rfx7F8VPJ6 1459 aa15.94■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kif3bQ61771 747 aa15.94■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Stk26Q99JT2 416 aa15.94■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa15.93■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plekhh1Q80TI1 1356 aa15.93■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Usp40Q8BWR4 1235 aa15.92■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plin1Q8CGN5 517 aa15.92■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 SlkO54988 1233 aa15.92■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rfx1P48377 963 aa15.92■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cd109Q8R422 1442 aa15.91■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sall3Q62255 1320 aa15.91■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Apaf1O88879 1249 aa15.9■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Atxn3Q9CVD2 355 aa15.9■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pprc1Q6NZN1 1644 aa15.9■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plb1Q3TTY0 1478 aa15.9■□□□□ 0.14
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Arid3cA6PWV5 409 aa15.89■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pde4cQ3UEI1 686 aa15.89■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gas2l2Q5SSG4 860 aa15.88■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nutm1Q8BHP2 1126 aa15.88■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Map3k5O35099 1380 aa15.88■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fgd1P52734 960 aa15.88■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa15.88■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa15.88■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Trim58Q5NCC9 485 aa15.87■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Wdr7Q920I9 1489 aa15.87■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Jph4Q80WT0 628 aa15.87■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa15.87■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Naip6Q9JIB6 1403 aa15.86■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Peg3Q3URU2 1571 aa15.86■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tsen2Q6P7W5 460 aa15.86■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PxdnQ3UQ28 1475 aa15.86■□□□□ 0.13
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Grin2aP35436 1464 aa15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.8 ms