RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042587.11

Pitx2-202, Transcript of Pituitary homeobox 2, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pitx2, Length 2,271 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa28.81■■■□□ 2.2
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Pitx2-202ENSMUST00000042587 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Setd1aE9PYH6 1716 aa28.78■■■□□ 2.2
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Clstn2Q9ER65 966 aa28.77■■■□□ 2.2
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Bcl11aQ9QYE3 773 aa28.77■■■□□ 2.2
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Pitx2-202ENSMUST00000042587 Trappc8E9PWG2 1437 aa28.54■■■□□ 2.16
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Pitx2-202ENSMUST00000042587 Ccdc27Q3V036 639 aa28.43■■■□□ 2.14
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Pitx2-202ENSMUST00000042587 NhsB1AV60 1647 aa28.31■■■□□ 2.12
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Ak9G3UYQ4 1894 aa28.28■■■□□ 2.12
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Nsd2Q8BVE8 1365 aa28.28■■■□□ 2.12
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa28.27■■■□□ 2.12
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Pola1P33609 1465 aa28.25■■■□□ 2.11
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Pitx2-202ENSMUST00000042587 Esx1O88933 382 aa28.23■■■□□ 2.11
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Srcin1Q9QWI6 1250 aa28.23■■■□□ 2.11
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Kif16bB1AVY7 1312 aa28.23■■■□□ 2.11
Pitx2-202ENSMUST00000042587 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
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