RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028950.8

Sdcbp2-201, Transcript of Syntenin-2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sdcbp2, Length 1,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Il16O54824 1322 aa14.88□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Chic2Q9D9G3 165 aa14.88□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Uggt2E9Q4X2 1504 aa14.88□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa14.88□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Scn4aQ9ER60 1841 aa14.87□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa14.87□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Topaz1E5FYH1 1653 aa14.87□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa14.87□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Plekhh2Q8C115 1491 aa14.87□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Fmn2Q9JL04 1578 aa14.86□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa14.85□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ssh2Q5SW75 1423 aa14.83□□□□□ -0.03
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 RictorQ6QI06 1708 aa14.83□□□□□ -0.04
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa14.83□□□□□ -0.04
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ncoa1P70365 1447 aa14.83□□□□□ -0.04
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa14.83□□□□□ -0.04
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Gm13697A2AK42 830 aa14.82□□□□□ -0.04
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Plch2A2AP18 1501 aa14.82□□□□□ -0.04
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Vps8Q0P5W1 1427 aa14.81□□□□□ -0.04
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Pde4cQ3UEI1 686 aa14.8□□□□□ -0.04
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Hfm1D3Z4R1 1434 aa14.78□□□□□ -0.04
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa14.75□□□□□ -0.05
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Abca17E9PX95 1733 aa14.74□□□□□ -0.05
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Abcc6Q9R1S7 1498 aa14.74□□□□□ -0.05
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Rapgef3Q8VCC8 918 aa14.73□□□□□ -0.05
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ecm2Q5FW85 670 aa14.72□□□□□ -0.05
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa14.71□□□□□ -0.05
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 ShprhQ7TPQ3 1674 aa14.7□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Robo2Q7TPD3 1470 aa14.7□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ttc21bQ0HA38 1315 aa14.69□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Hspa1lP16627 641 aa14.68□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 AlkP97793 1621 aa14.67□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 NclP09405 707 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Zfp644E9QA22 1323 aa14.67□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Adamts7Q68SA9 1657 aa14.67□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Prex1Q69ZK0 1650 aa14.67□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Fhad1A6PWD2 1420 aa14.64□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Map4P27546 1125 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 UbtfP25976 765 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 UacaQ8CGB3 1411 aa14.63□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa14.62□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Gli3Q61602 1583 aa14.62□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Rims2Q9EQZ7 1530 aa14.62□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Myo5cE9Q1F5 1742 aa14.61□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 PzpQ61838 1495 aa14.6□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Clstn2Q9ER65 966 aa14.6□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 AnkarA2RT91 1465 aa14.59□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Rfx7F8VPJ6 1459 aa14.59□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa14.59□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Asxl1P59598 1514 aa14.58□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa14.58□□□□□ -0.07
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Skint5A7XUY5 1461 aa14.57□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Txndc2Q6P902 515 aa14.57□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ttll5Q8CHB8 1328 aa14.56□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Myom3A2ABU4 1439 aa14.56□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 IghaA0A0A6YXW6 389 aa14.56□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Iqsec2Q5DU25 1478 aa14.56□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Akap12Q9WTQ5 1684 aa14.55□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa14.54□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Amigo3Q8C2S7 508 aa14.54□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Naip7Q9JIB3 1402 aa14.53□□□□□ -0.08
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 GapdhsQ64467 440 aa14.51□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa14.51□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Bcl11bQ99PV8 884 aa14.5□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa14.5□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Nsd2Q8BVE8 1365 aa14.5□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Cd109Q8R422 1442 aa14.49□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Psme1P97371 249 aa14.49□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Stk24Q99KH8 431 aa14.49□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Tecpr2Q3UH45 1423 aa14.49□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Erich6D3Z6S9 713 aa14.48□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Trak1Q6PD31 939 aa14.48□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 P3h3Q8CG70 732 aa14.47□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa14.47□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Med1Q925J9 1575 aa14.47□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 PtprgQ05909 1442 aa14.47□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Efcab6Q6P1E8 1516 aa14.47□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ino80Q6ZPV2 1559 aa14.47□□□□□ -0.09
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Ube2uB1AUC4 352 aa14.46□□□□□ -0.1
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Kif13aQ9EQW7 1749 aa14.45□□□□□ -0.1
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa14.45□□□□□ -0.1
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Sall3Q62255 1320 aa14.45□□□□□ -0.1
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
Sdcbp2-201ENSMUST00000028950 Mia2Q91ZV0 1396 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.2 ms