RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grin2aP35436 1464 aa16.44■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SynmQ70IV5 1561 aa16.43■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd109Q8R422 1442 aa16.43■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q3TQI7 289 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tsen2Q6P7W5 460 aa16.42■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D9H8 365 aa16.42■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B4galnt3Q6L8S8 986 aa16.42■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Afap1Q80YS6 731 aa16.41■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igf1rQ60751 1373 aa16.4■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc4a3P16283 1227 aa16.4■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnnt1O88346 262 aa16.39■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tiam1Q60610 1591 aa16.39■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zscan10Q3URR7 782 aa16.39■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif7B7ZNG0 1348 aa16.39■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ksr2Q3UVC0 959 aa16.39■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il16O54824 1322 aa16.38■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mug1P28665 1476 aa16.37■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa16.37■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pibf1E9Q6K3 756 aa16.37■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Map7O88735 730 aa16.36■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa16.36■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa16.36■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa16.36■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf330Q922H9 316 aa16.35■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa16.35■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Magi1Q6RHR9 1471 aa16.34■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chmp5Q9D7S9 219 aa16.34■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gsto1O09131 240 aa16.33■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stk31Q99MW1 1018 aa16.33■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GsdmaQ9EST1 446 aa16.33■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vsig10D3YX43 558 aa16.32■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pak3Q61036 559 aa16.32■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa16.31■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A2mQ6GQT1 1474 aa16.3■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rock1P70335 1354 aa16.3■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Esx1O88933 382 aa16.3■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pip4k2bQ80XI4 416 aa16.3■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8BT18 775 aa16.29■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cluap1Q8R3P7 413 aa16.28■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Supt16hQ920B9 1047 aa16.28■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NexmifQ5DTT1 1515 aa16.27■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam71e1A1L3C1 212 aa16.27■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fyb1O35601 819 aa16.26■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppm1gQ61074 542 aa16.26■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myom3A2ABU4 1439 aa16.26■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abcc5Q9R1X5 1436 aa16.25■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcf11G3X9Z4 1553 aa16.24■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa16.23■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FanciQ8K368 1330 aa16.22■□□□□ 0.19
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Naip2Q9QUK4 1447 aa16.2■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc60Q8C4J0 545 aa16.2■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bcl11bQ99PV8 884 aa16.2■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp10dQ8K2X1 1416 aa16.2■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nol10Q5RJG1 687 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Disp1Q3TDN0 1521 aa16.19■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atf3Q60765 181 aa16.19■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ralbp1Q62172 648 aa16.19■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf326O88291 580 aa16.18■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm156Q58A37 223 aa16.18■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpatch8A2A6A1 1505 aa16.18■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EspnQ9ET47 871 aa16.18■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa16.17■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc21bQ0HA38 1315 aa16.16■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam135aQ6NS59 1506 aa16.15■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plcb2A3KGF7 1181 aa16.15■□□□□ 0.18
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TatQ8QZR1 454 aa16.14■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clstn1Q9EPL2 979 aa16.14■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh3bp5Q9Z131 463 aa16.13■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q7TT23 1179 aa16.13■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Htatsf1Q8BGC0 757 aa16.13■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Evi5lH3BKQ3 813 aa16.12■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa16.12■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ncoa3O09000 1398 aa16.12■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Caskin1Q6P9K8 1431 aa16.12■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chmp7Q8R1T1 451 aa16.12■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sall3Q62255 1320 aa16.11■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd26Q811D2 1581 aa16.11■□□□□ 0.17
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MccE9PWI3 1003 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14 ms