RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025667.12

Rtn3-201, Transcript of Reticulon-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rtn3, Length 2,841 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtn3-201ENSMUST00000025667 Ddrgk1Q80WW9 315 aa20.56■□□□□ 0.88
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Rtn3-201ENSMUST00000025667 Shroom2A2ALU4 1481 aa20.55■□□□□ 0.88
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Rtn3-201ENSMUST00000025667 Trim44Q9QXA7 346 aa20.52■□□□□ 0.88
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Rtn3-201ENSMUST00000025667 Myom3A2ABU4 1439 aa20.41■□□□□ 0.86
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Rtn3-201ENSMUST00000025667 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa20.38■□□□□ 0.85
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Pcf11G3X9Z4 1553 aa20.38■□□□□ 0.85
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Rtn3-201ENSMUST00000025667 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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Rtn3-201ENSMUST00000025667 Q7TT23 1179 aa20.29■□□□□ 0.84
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Plcd3Q8K2J0 785 aa20.29■□□□□ 0.84
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Rwdd1Q9CQK7 243 aa20.28■□□□□ 0.84
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Cux1P53564 1515 aa20.28■□□□□ 0.84
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Rtn3-201ENSMUST00000025667 Rabep1O35551 862 aa20.22■□□□□ 0.83
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Rtn3-201ENSMUST00000025667 Col17a1Q07563 1470 aa20.21■□□□□ 0.83
Rtn3-201ENSMUST00000025667 BC005561E9Q5E2 1589 aa20.21■□□□□ 0.83
Rtn3-201ENSMUST00000025667 Soga1E1U8D0 1418 aa20.21■□□□□ 0.83
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Rtn3-201ENSMUST00000025667 Neo1P97798 1493 aa20.2■□□□□ 0.83
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