RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000024779.14

Usp49-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp49, Length 8,252 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gabpb2P81069 414 aa20,36■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Smc4Q8CG47 1286 aa20,35■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 AppP12023 770 aa20,35■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP20,34■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ksr2Q3UVC0 959 aa20,34■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP20,34■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 A0A1L1SQF0 893 aa20,34■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rpap1Q80TE0 1409 aa20,34■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Evc2Q8K1G2 1220 aa20,33■□□□□ 0,85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP20,31■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP20,31■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fyco1Q8VDC1 1437 aa20,31■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP20,31■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP20,31■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP20,3■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 St18Q80TY4 1045 aa20,3■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa20,3■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP20,29■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 CenpjQ569L8 1344 aa20,29■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Filip1lQ6P6L0 1131 aa20,29■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Chrna2Q91X60 512 aa20,29■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cplx2P84086 134 aa20,29■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa20,29■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ipo9Q91YE6 1041 aa20,29■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Trak1Q6PD31 939 aa20,27■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Arhgap35Q91YM2 1499 aa20,27■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cgnl1Q6AW69 1298 aa20,27■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hook1Q8BIL5 728 aa20,27■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rsph3aQ3UFY4 516 aa20,27■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Nap1l3Q794H2 544 aa20,27■□□□□ 0,84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP20,25■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP20,24■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Stard8Q8K031 1019 aa20,24■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Plekhh2Q8C115 1491 aa20,24■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc34Q3UI66 367 aa20,24■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP20,24■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ddrgk1Q80WW9 315 aa20,24■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Srcin1Q9QWI6 1250 aa20,24■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Stk31Q99MW1 1018 aa20,23■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa20,22■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa20,22■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa20,21■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 UvssaQ9D479 717 aa20,21■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cabp4Q8VHC5 271 aa20,21■□□□□ 0,83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccp110Q7TSH4 1004 aa20,2■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Exoc6Q8R313 802 aa20,2■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 VgfQ0VGU4 617 aa20,2■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Drc7Q6V3W6 876 aa20,2■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 March6Q6ZQ89 909 aa20,2■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 CrbnQ8C7D2 445 aa20,19■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP20,19■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 SlkO54988 1233 aa20,19■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cplx1P63040 134 aa20,19■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Kif3bQ61771 747 aa20,18■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP20,18■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ppp4r3bQ922R5 820 aa20,17■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hap1O35668 628 aa20,17■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tceal9Q9DD24 104 aa20,17■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ush1cQ9ES64 910 aa20,17■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Chmp7Q8R1T1 451 aa20,16■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rufy1Q8BIJ7 712 aa20,15■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Mphosph9A6H5Y1 991 aa20,15■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc146E9Q9F7 977 aa20,15■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP20,15■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP20,15■□□□□ 0,82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rec8Q8C5S7 591 aa20,14■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gcom1E9PZ54 550 aa20,14■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 MyzapQ3UIJ9 466 aa20,14■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP20,13■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 CrcpO35427 148 aa20,13■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP20,13■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Taf3Q5HZG4 932 aa20,13■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rnf20Q5DTM8 973 aa20,12■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tsen2Q6P7W5 460 aa20,12■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Aebp1Q640N1 1128 aa20,11■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP20,11■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP20,11■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Baz1bQ9Z277 1479 aa20,11■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Dusp9Q7TNL7 452 aa20,11■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Casq1O09165 405 aa20,09■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 KinQ8K339 391 aa20,09■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fan1Q69ZT1 1020 aa20,08■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Sycp1Q62209 993 aa20,08■□□□□ 0,81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Bcl11bQ99PV8 884 aa20,08■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP20,08■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa20,07■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Chaf1aQ9QWF0 911 aa20,07■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Eva1cP58659 440 aa20,07■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa20,07■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Necab1Q8BG18 352 aa20,07■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 CntlnA2AM05 1397 aa20,06■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cabp1Q9JLK7 227 aa20,05■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fmn1Q05860 1466 aa20,05■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP20,05■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Bicd2Q921C5 820 aa20,04■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gpatch3Q8BIY1 525 aa20,04■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 NexnQ7TPW1 607 aa20,03■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc60Q8C4J0 545 aa20,03■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP20,03■□□□□ 0,8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Neurod6P48986 337 aa20,03■□□□□ 0,8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19,1 ms