RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000024779.14

Usp49-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp49, Length 8,252 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gabpb2P81069 414 aa20.36■□□□□ 0.85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Smc4Q8CG47 1286 aa20.35■□□□□ 0.85
Usp49-201ENSMUST00000024779 AppP12023 770 aa20.35■□□□□ 0.85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ksr2Q3UVC0 959 aa20.34■□□□□ 0.85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Usp49-201ENSMUST00000024779 A0A1L1SQF0 893 aa20.34■□□□□ 0.85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rpap1Q80TE0 1409 aa20.34■□□□□ 0.85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Evc2Q8K1G2 1220 aa20.33■□□□□ 0.85
Usp49-201ENSMUST00000024779 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fyco1Q8VDC1 1437 aa20.31■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 St18Q80TY4 1045 aa20.3■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa20.3■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ipo7Q9EPL8 1038 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 CenpjQ569L8 1344 aa20.29■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Filip1lQ6P6L0 1131 aa20.29■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Chrna2Q91X60 512 aa20.29■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cplx2P84086 134 aa20.29■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa20.29■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ipo9Q91YE6 1041 aa20.29■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Trak1Q6PD31 939 aa20.27■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Arhgap35Q91YM2 1499 aa20.27■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cgnl1Q6AW69 1298 aa20.27■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hook1Q8BIL5 728 aa20.27■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rsph3aQ3UFY4 516 aa20.27■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Nap1l3Q794H2 544 aa20.27■□□□□ 0.84
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Stard8Q8K031 1019 aa20.24■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Plekhh2Q8C115 1491 aa20.24■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc34Q3UI66 367 aa20.24■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ddrgk1Q80WW9 315 aa20.24■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Srcin1Q9QWI6 1250 aa20.24■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Stk31Q99MW1 1018 aa20.23■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa20.22■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa20.22■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa20.21■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 UvssaQ9D479 717 aa20.21■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cabp4Q8VHC5 271 aa20.21■□□□□ 0.83
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccp110Q7TSH4 1004 aa20.2■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Exoc6Q8R313 802 aa20.2■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 VgfQ0VGU4 617 aa20.2■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Drc7Q6V3W6 876 aa20.2■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 March6Q6ZQ89 909 aa20.2■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 CrbnQ8C7D2 445 aa20.19■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 SlkO54988 1233 aa20.19■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cplx1P63040 134 aa20.19■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Kif3bQ61771 747 aa20.18■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ppp4r3bQ922R5 820 aa20.17■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hap1O35668 628 aa20.17■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tceal9Q9DD24 104 aa20.17■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ush1cQ9ES64 910 aa20.17■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Chmp7Q8R1T1 451 aa20.16■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rufy1Q8BIJ7 712 aa20.15■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Mphosph9A6H5Y1 991 aa20.15■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc146E9Q9F7 977 aa20.15■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rec8Q8C5S7 591 aa20.14■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gcom1E9PZ54 550 aa20.14■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 MyzapQ3UIJ9 466 aa20.14■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 CrcpO35427 148 aa20.13■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Taf3Q5HZG4 932 aa20.13■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Rnf20Q5DTM8 973 aa20.12■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Tsen2Q6P7W5 460 aa20.12■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Aebp1Q640N1 1128 aa20.11■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 HmmrQ00547 794 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Baz1bQ9Z277 1479 aa20.11■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Dusp9Q7TNL7 452 aa20.11■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Casq1O09165 405 aa20.09■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 KinQ8K339 391 aa20.09■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fan1Q69ZT1 1020 aa20.08■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Sycp1Q62209 993 aa20.08■□□□□ 0.81
Usp49-201ENSMUST00000024779 Bcl11bQ99PV8 884 aa20.08■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa20.07■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Chaf1aQ9QWF0 911 aa20.07■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Eva1cP58659 440 aa20.07■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa20.07■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Necab1Q8BG18 352 aa20.07■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 CntlnA2AM05 1397 aa20.06■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Cabp1Q9JLK7 227 aa20.05■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Fmn1Q05860 1466 aa20.05■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Bicd2Q921C5 820 aa20.04■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Gpatch3Q8BIY1 525 aa20.04■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 NexnQ7TPW1 607 aa20.03■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Ccdc60Q8C4J0 545 aa20.03■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Usp49-201ENSMUST00000024779 Neurod6P48986 337 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.2 ms