RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fgd6Q69ZL1 1399 aa35,77■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PtprgQ05909 1442 aa35,76■■■■□ 3,32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP35,75■■■■□ 3,31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Asxl1P59598 1514 aa35,75■■■■□ 3,31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP35,73■■■■□ 3,31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP35,71■■■■□ 3,31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa35,71■■■■□ 3,31
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Polr3aB2RXC6 1390 aa35,69■■■■□ 3,3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Clstn2Q9ER65 966 aa35,69■■■■□ 3,3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP35,66■■■■□ 3,3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rock1P70335 1354 aa35,64■■■■□ 3,3
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm14025A2AP89 1413 aa35,63■■■■□ 3,29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cd109Q8R422 1442 aa35,63■■■■□ 3,29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnf17Q99MV7 1640 aa35,62■■■■□ 3,29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rock2P70336 1388 aa35,61■■■■□ 3,29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp7aQ64430 1491 aa35,6■■■■□ 3,29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zbtb4Q5F293 982 aa35,59■■■■□ 3,29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa35,58■■■■□ 3,29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mast1Q9R1L5 1570 aa35,58■■■■□ 3,29
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ofd1Q80Z25 1017 aa35,57■■■■□ 3,28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP35,55■■■■□ 3,28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP35,53■■■■□ 3,28
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tarbp1E9Q368 1579 aa35,5■■■■□ 3,27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cfap74Q3UY96 1578 aa35,49■■■■□ 3,27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Neurl4Q5NCX5 1563 aa35,45■■■■□ 3,27
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP35,45■■■■□ 3,26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NhsB1AV60 1647 aa35,44■■■■□ 3,26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa35,43■■■■□ 3,26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa35,43■■■■□ 3,26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Supt16hQ920B9 1047 aa35,42■■■■□ 3,26
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa35,38■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abcc3B2RX12 1523 aa35,38■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hecw1Q8K4P8 1604 aa35,38■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map3k5O35099 1380 aa35,37■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AI481877A2ALV5 1481 aa35,37■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abcc1O35379 1528 aa35,37■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 L3mbtl2P59178 703 aa35,37■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pde4cQ3UEI1 686 aa35,37■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdm5cP41230 1554 aa35,37■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa35,36■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa35,35■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prdm16A2A935 1275 aa35,34■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Chd1P40201 1711 aa35,33■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp10dQ8K2X1 1416 aa35,33■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa35,33■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Setd1aE9PYH6 1716 aa35,32■■■■□ 3,25
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adamts13Q769J6 1426 aa35,31■■■■□ 3,24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa35,3■■■■□ 3,24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa35,29■■■■□ 3,24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abca8bQ8K440 1620 aa35,28■■■■□ 3,24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa35,27■■■■□ 3,24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Robo2Q7TPD3 1470 aa35,27■■■■□ 3,24
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP35,26■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP35,25■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q7TT23 1179 aa35,24■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pank3Q8R2W9 370 aa35,24■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep170Q6A065 1588 aa35,23■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf608Q56A10 1511 aa35,22■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zscan21Q07231 555 aa35,22■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PrxO55103 1391 aa35,21■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa35,21■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Erich6D3Z6S9 713 aa35,2■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP35,2■■■■□ 3,23
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Inpp5dQ9ES52 1191 aa35,19■■■■□ 3,22
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kidins220E9Q9B7 1793 aa35,17■■■■□ 3,22
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ShprhQ7TPQ3 1674 aa35,16■■■■□ 3,22
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcnh8P59111 1102 aa35,16■■■■□ 3,22
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP35,16■■■■□ 3,22
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc4a3P16283 1227 aa35,14■■■■□ 3,22
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tulp4Q9JIL5 1547 aa35,13■■■■□ 3,22
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nsd2Q8BVE8 1365 aa35,12■■■■□ 3,21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Erbb3Q61526 1339 aa35,12■■■■□ 3,21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP35,12■■■■□ 3,21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Liat1Q810M6 228 aa35,11■■■■□ 3,21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP35,11■■■■□ 3,21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kdm2aP59997 1161 aa35,09■■■■□ 3,21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sall3Q62255 1320 aa35,08■■■■□ 3,21
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zscan10Q3URR7 782 aa35,07■■■■□ 3,2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kank1E9Q238 1360 aa35,07■■■■□ 3,2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abca17E9PX95 1733 aa35,06■■■■□ 3,2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa35,05■■■■□ 3,2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP35,05■■■■□ 3,2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pak3Q61036 559 aa35,04■■■■□ 3,2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP35,03■■■■□ 3,2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmf1B9EKI3 1091 aa35,02■■■■□ 3,2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Srcin1Q9QWI6 1250 aa35,02■■■■□ 3,2
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plch2A2AP18 1501 aa35■■■■□ 3,19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kif3bQ61771 747 aa35■■■■□ 3,19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Abcc6Q9R1S7 1498 aa35■■■■□ 3,19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Igf1rQ60751 1373 aa34,99■■■■□ 3,19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc4a1apE9PX68 744 aa34,99■■■■□ 3,19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rtl5Q5DTT4 599 aa34,99■■■■□ 3,19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP34,98■■■■□ 3,19
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP34,94■■■■□ 3,18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP34,93■■■■□ 3,18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sbno1Q689Z5 1390 aa34,92■■■■□ 3,18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Os9Q8K2C7 672 aa34,91■■■■□ 3,18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tex14Q7M6U3 1450 aa34,91■■■■□ 3,18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myo5cE9Q1F5 1742 aa34,9■■■■□ 3,18
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP34,9■■■■□ 3,18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,1 ms