RNA–Protein interactions for RNA: YOR106W

VAM3, Transcript of Syntaxin-like vacuolar t-SNARE, yeast

Gene VAM3, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAM3	YOR106W	AST1	P35183	429 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	CPR7	P47103	393 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	MPS2	P53159	387 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	INP2	Q03824	705 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	YPR078C	Q06813	372 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	MMT2	Q08970	484 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	APC2	Q12440	853 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	FSH3	Q99369	266 aa		3.13	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	FRM2	P37261	193 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	EFM3	P47163	339 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	TRM82	Q03774	444 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	SLM3	Q12093	417 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	FRE8	Q12209	686 aa		3.12	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	URA10	P30402	227 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	AGA2	P32781	87 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	UFE1	P41834	346 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	YNL320W	P42840	284 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	ZRG17	P53735	605 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	DIA1	P54005	336 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	AIM33	Q04516	312 aa		3.11	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	YKL071W	P36086	256 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	RBG1	P39729	369 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	LST7	P53237	242 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	SUR7	P54003	302 aa		3.1	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	FAR1	P21268	830 aa		3.09	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	EFM1	P38732	585 aa		3.09	□□□□□ -1.91
VAM3	YOR106W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	TIP20	P33891	701 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	RCK2	P38623	610 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	YIL059C	P40520	121 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	SMP3	Q04174	516 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	ALE1	Q08548	619 aa		3.08	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	PCH2	P38126	564 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	NRM1	P53718	249 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	APC4	Q04601	652 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	FAR10	Q06001	478 aa		3.07	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	ATG7	P38862	630 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	BDH1	P39714	382 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	HIT1	P46973	164 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	RPN14	P53196	417 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	SCS7	Q03529	384 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	VTI1	Q04338	217 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	YDL211C	Q12121	372 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	GLE1	Q12315	538 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	ERP4	Q12450	207 aa		3.06	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	TAE1	P38340	232 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	SPO73	P40031	143 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	JEM1	P40358	645 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	COS4	P43542	379 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	NAS6	P50086	228 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	PRM1	P53835	661 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	APC5	Q08683	685 aa		3.05	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	MAS1	P10507	462 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	CKI1	P20485	582 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	GRR1	P24814	1151 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	PUP2	P32379	260 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	SRB2	P34162	210 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	YFR018C	P43599	363 aa		3.04	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	COX10	P21592	462 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	YSW1	P38280	609 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	YNR068C	P53754	272 aa		3.03	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
VAM3	YOR106W	VPS63	O13549	108 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	YPR096C	O13587	100 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	HMX1	P32339	317 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	IST2	P38250	946 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	GMC1	Q04399	608 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	CSM3	Q04659	317 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.02	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	CPT1	P17898	393 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	MKK1	P32490	508 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	MRPS5	P33759	307 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	YMR262W	P38430	313 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	NAT4	Q04751	285 aa		3.01	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	CUP2	P15315	225 aa		3	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	INP1	Q03694	420 aa		3	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	TAF10	Q12030	206 aa		3	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	MXR2	P25566	168 aa		2.99	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.99	□□□□□ -1.93	not detected
VAM3	YOR106W	DAD2	P36162	133 aa		2.99	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	YJL144W	P47009	104 aa		2.99	□□□□□ -1.93
VAM3	YOR106W	YHC3	P47040	408 aa		2.99	□□□□□ -1.93

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