RNA–Protein interactions for RNA: YMR250W

GAD1, Transcript of Glutamate decarboxylase, yeast

Gene GAD1, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GAD1	YMR250W	YPT7	P32939	208 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	YER158C	P40095	573 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	YTA6	P40328	754 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	AIM20	P40451	204 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	IRC6	P43615	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	MDV1	P47025	714 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	SLD3	P53135	668 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	BUD9	P53226	547 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	NUP53	Q03790	475 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	CRT10	Q08226	957 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	UIP4	Q08926	304 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	SPC3	Q12133	184 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	FRE7	Q12333	620 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	MED11	Q99278	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
GAD1	YMR250W	FLP1	P03870	423 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	PBN1	P25580	416 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	LDB16	P25587	256 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YCR100C	P25606	316 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	HSP150	P32478	413 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MRPL16	P38064	232 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YBR139W	P38109	508 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RTC2	P38279	296 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	NSG1	P38837	291 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YJL193W	P39542	402 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	AVT6	P40074	448 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	QRI7	P43122	407 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	CHA4	P43634	648 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	DML1	Q03652	475 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ATG17	Q06410	417 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	CYK3	Q07533	885 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	VCX1	Q99385	411 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.09	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	TFS1	P14306	219 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	CPR3	P25719	182 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	VPH2	P32341	215 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SEF1	P34228	1148 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YKL077W	P36081	392 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ECM4	P36156	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YEL068C	P39977	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RET2	P43621	546 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YFR054C	P43622	192 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	IKS1	P47042	667 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YNR062C	P53748	327 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	RSM10	Q03201	203 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	EKI1	Q03764	534 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	CDA2	Q06703	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	SYO1	Q07395	620 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	GSH2	Q08220	491 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YRM1	Q12340	786 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YOS9	Q99220	542 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	DFG16	Q99234	619 aa		4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MET17	P06106	444 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YPK2	P18961	677 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MRPS28	P21771	286 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	PUP1	P25043	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	CWH43	P25618	953 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	HSP30	P25619	332 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	OAC1	P32332	324 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	TIM12	P32830	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ECM15	P35195	104 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	JEN1	P36035	616 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ALG3	P38179	458 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
GAD1	YMR250W	YLF2	P38746	405 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	PEX18	P38855	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YHR180W	P38868	163 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
GAD1	YMR250W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YIL166C	P40445	542 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YIL067C	P40514	678 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ASI1	P54074	624 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	ELP6	Q04868	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
GAD1	YMR250W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.4 ms