RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C ORC5P50874 479 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C LST7P53237 242 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SLX9P53251 210 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C MSS11Q03825 758 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SSK1Q07084 712 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SRL2Q12020 392 aa5.95□□□□□ -1.46
SHO1YER118C MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data5.95□□□□□ -1.46not detected
SHO1YER118C RPB8P20436 146 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data5.94□□□□□ -1.46not detected
SHO1YER118C PPZ2P33329 710 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YKR073CP36153 106 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C MRX3P38172 270 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C PRS2P38620 318 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C TDA11P38854 504 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C IBA57P47158 497 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C ASN1P49089 572 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YIP1P53039 248 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YGL159WP53110 370 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C EBS1Q03466 884 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C NDE2Q07500 545 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SGT1Q08446 395 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C ALE1Q08548 619 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C CSM4Q08955 156 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YOP1Q12402 180 aa5.94□□□□□ -1.46
SHO1YER118C MBR1P23493 339 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YCR007CP25354 239 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C LSB5P25369 354 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C NDC1P32500 655 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YCR041WP37265 110 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C RCK2P38623 610 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C PCL5P38794 229 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C NPT1P39683 429 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C RBG1P39729 369 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SIM1P40472 476 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YFL040WP43562 540 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C TIS11P47977 285 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C IMD3P50095 523 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C MNN10P50108 393 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C NSG2P53898 299 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YPL077CQ02831 240 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SLD5Q03406 294 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C DIC1Q06143 298 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C ASR1Q06834 288 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YDL144CQ07589 356 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YDL218WQ07629 317 aa5.93□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YDR157WA0A023PZE8 133 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C MKK1P32490 508 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C ZRT1P32804 376 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C MRPL6P32904 214 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SPO23P33757 523 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YPT52P36018 234 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C FES1P38260 290 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C COX15P40086 486 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C IDP2P41939 412 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YCH1P42937 148 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C KEG1P43614 200 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C TAD2P47058 250 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C MIG2P53035 382 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C CAF40P53829 373 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C VBA1Q04301 562 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C ARP10Q04549 284 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C CSM3Q04659 317 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C THI7Q05998 598 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SNA4Q07549 140 aa5.92□□□□□ -1.46
SHO1YER118C ILV1P00927 576 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C RNA15P25299 296 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C RFA3P26755 122 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C ECM15P35195 104 aa5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C ARN1P38731 627 aa5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C HAT2P39984 401 aa5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C FRE4P53746 719 aa5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C IRC4Q03036 179 aa5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C BET5Q03630 159 aa5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SWF1Q04629 336 aa5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C NCA2Q12374 616 aa5.91□□□□□ -1.46
SHO1YER118C PGK1P00560 416 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C BI2P03873 423 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C HEM1P09950 548 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C ITR2P30606 609 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SSO1P32867 290 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C CSE1P33307 960 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C MCR1P36060 302 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C AIM3P38266 947 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YHR035WP38769 630 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YER184CP39961 794 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YPT32P51996 222 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C CPD1P53314 239 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C VAC7P53950 1165 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C SPR6Q01684 191 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C LGE1Q02796 332 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C YDR209CQ03480 137 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C POM33Q12164 279 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C RGT2Q12300 763 aa5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C DET1Q99288 334 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SHO1YER118C EDE1P34216 1381 aa5.9□□□□□ -1.47
SHO1YER118C SSN2P38931 1420 aa5.9□□□□□ -1.47
SHO1YER118C NAM2P11325 894 aa5.89□□□□□ -1.47
SHO1YER118C HRR25P29295 494 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SHO1YER118C ATO2P32907 282 aa5.89□□□□□ -1.47
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