RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 RFX1P22670 979 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 FMO5P49326 533 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 CYP2J2P51589 502 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SPP2Q13103 211 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 L1RE1Q9UN81 338 aa20.22■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ZNF185O15231 689 aa20.21■□□□□ 0.83
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CLN8-211ENST00000636934 CCND2P30279 289 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 RARRES1P49788 294 aa20.21■□□□□ 0.83
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CLN8-211ENST00000636934 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 C12orf42Q96LP6 360 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.21■□□□□ 0.83
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CLN8-211ENST00000636934 BCS1LQ9Y276 419 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 C19orf81C9J6K1 198 aa20.21■□□□□ 0.83
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CLN8-211ENST00000636934 NSMFQ6X4W1 530 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.21■□□□□ 0.83
CLN8-211ENST00000636934 INTUQ9ULD6 942 aa20.21■□□□□ 0.83
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CLN8-211ENST00000636934 COG2Q14746 738 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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CLN8-211ENST00000636934 STK33Q9BYT3 514 aa20.2■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 MAPK13O15264 365 aa20.19■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 MYL7Q01449 175 aa20.19■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 BFSP1Q12934 665 aa20.19■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.19■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 ATG4CQ96DT6 458 aa20.19■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 TLR10Q9BXR5 811 aa20.19■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 P4HA2O15460 535 aa20.18■□□□□ 0.82
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CLN8-211ENST00000636934 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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CLN8-211ENST00000636934 KSR1Q8IVT5 923 aa20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 COG1Q8WTW3 980 aa20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 HVCN1Q96D96 273 aa20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 WRNIP1Q96S55 665 aa20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 NAGPAQ9UK23 515 aa20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 SOX5P35711 763 aa20.18■□□□□ 0.82
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CLN8-211ENST00000636934 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.18■□□□□ 0.82
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CLN8-211ENST00000636934 CES2O00748 559 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 H2AFZP0C0S5 128 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 LMNB1P20700 586 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 DSG3P32926 999 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 GTF2BQ00403 316 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 C2orf54Q08AI8 447 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 CASP8Q14790 479 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 H2AFVQ71UI9 128 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 TAF4BQ92750 862 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 CDHR1Q96JP9 859 aa20.17■□□□□ 0.82
CLN8-211ENST00000636934 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.17■□□□□ 0.82
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