RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635899.1

CREBBP-215, Transcript of CREB binding protein, human

TSL 5

Gene CREBBP, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREBBP-215	ENST00000635899	ADAMTS3	O15072	1205 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	HOXA2	O43364	376 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ATP4A	P20648	1035 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	FGFR4	P22455	802 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	PPM1A	P35813	382 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	GPC3	P51654	580 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	RCAN1	P53805	252 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	PTPN5	P54829	565 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ZXDA	P98168	799 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	KRT32	Q14532	448 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	UGCG	Q16739	394 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	PTPN21	Q16825	1174 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	MTERF2	Q49AM1	385 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	RASEF	Q8IZ41	740 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	FBXL6	Q8N531	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	NLRP7	Q8WX94	980 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	BRF1	Q92994	677 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	PHKB	Q93100	1093 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF558	Q96NG5	402 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	C6orf50	Q9HD87	102 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	RNF19A	Q9NV58	838 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	NUP205	Q92621	2012 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	PTPRD	P23468	1912 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TMEM150B	A6NC51	233 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	HIDE1	A8MVS5	230 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	MAGEB2	O15479	319 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ZNF862	O60290	1169 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	GAS7	O60861	476 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	GPR32	O75388	356 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	CYP3A4	P08684	503 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TMOD1	P28289	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	GNA11	P29992	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	JAK3	P52333	1124 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	MTMR3	Q13615	1198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	DSC3	Q14574	896 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	IER5L	Q5T953	404 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	MCTP2	Q6DN12	878 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899		Q6ZUG5	572 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TMC7	Q7Z402	723 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	BICD2	Q8TD16	824 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	SUSD6	Q92537	303 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	CASP10	Q92851	521 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	GJA10	Q969M2	543 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	LENG9	Q96B70	501 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TMEM169	Q96HH4	297 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	NLRP4	Q96MN2	994 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	CASD1	Q96PB1	797 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CREBBP-215	ENST00000635899	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		5.06	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms