RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618534.4

NEK3-208, Transcript of NIMA related kinase 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene NEK3, Length 2,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3-208ENST00000618534 CCDC17Q96LX7 622 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PPFIA2O75334 1257 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PTENP60484 403 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 COG2Q14746 738 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PLCB4Q15147 1175 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 KSR1Q8IVT5 923 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PSMD1Q99460 953 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 AMNQ9BXJ7 453 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 STK33Q9BYT3 514 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 COA1Q9GZY4 146 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.14■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 LY75O60449 1722 aa22.13■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 DRP2Q13474 957 aa22.13■■□□□ 1.13
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NEK3-208ENST00000618534 SYT11Q9BT88 431 aa22.13■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.13■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 GPR88Q9GZN0 384 aa22.13■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 C5orf60A6NFR6 353 aa22.12■■□□□ 1.13
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NEK3-208ENST00000618534 SMTNP53814 917 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PLS1Q14651 629 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 VPS72Q15906 364 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 RAB17Q9H0T7 212 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 FAM13AO94988 1023 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 GYS1P13807 737 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 DR1Q01658 176 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CBWD6Q4V339 395 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 MYCT1Q8N699 235 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 MKL1Q969V6 931 aa22.12■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 GAP43P17677 238 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CACNB3P54284 484 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 FBXO11Q86XK2 927 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PALB2Q86YC2 1186 aa22.11■■□□□ 1.13
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NEK3-208ENST00000618534 TATDN2Q93075 761 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 TLCD1Q96CP7 247 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 STK24Q9Y6E0 443 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CAND2O75155 1236 aa22.11■■□□□ 1.13
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NEK3-208ENST00000618534 TRIM49P0CI25 452 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 TRIM49CP0CI26 452 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 DDR1Q08345 913 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 DUPD1Q68J44 220 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 GLG1Q92896 1179 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 C8orf37Q96NL8 207 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 THAP2Q9H0W7 228 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CARD9Q9H257 536 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 KLC4Q9NSK0 619 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 NYAP2Q9P242 653 aa22.11■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 SHBGP04278 402 aa22.1■■□□□ 1.13
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NEK3-208ENST00000618534 TCP10Q12799 353 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 DOK7Q18PE1 504 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CCDC114Q96M63 670 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 ERP44Q9BS26 406 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 PNMA2Q9UL42 364 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 COG5Q9UP83 839 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 SIPA1L1O43166 1804 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 DNM1LO00429 736 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 ALG3Q92685 438 aa22.1■■□□□ 1.13
NEK3-208ENST00000618534 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.1■■□□□ 1.13
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