RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616685.1

NOP16-208, Transcript of NOP16 nucleolar protein, human

TSL 3 BASIC

Gene NOP16, Length 472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP16-208	ENST00000616685	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NOP16-208	ENST00000616685	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NOP16-208	ENST00000616685	ZNF558	Q96NG5	402 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NOP16-208	ENST00000616685	TCF25	Q9BQ70	676 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NOP16-208	ENST00000616685	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NOP16-208	ENST00000616685	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NOP16-208	ENST00000616685	CPLX1	O14810	134 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	MSH4	O15457	936 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	IFNAR1	P17181	557 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	ERVFC1	P60507	584 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	KRT17	Q04695	432 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	DSC3	Q14574	896 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	KCNB2	Q92953	911 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	LENG9	Q96B70	501 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	RIT2	Q99578	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	KCNH6	Q9H252	994 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	LZTS1	Q9Y250	596 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	ZNF862	O60290	1169 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	TEC	P42680	631 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	GPC3	P51654	580 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	USP11	P51784	963 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	UGCG	Q16739	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	MTERF2	Q49AM1	385 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	TBCK	Q8TEA7	893 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	EDA	Q92838	391 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	SLC5A5	Q92911	643 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	CWH43	Q9H720	699 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	TMEM221	A6NGB7	291 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685		M0R296	226 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	FSCN2	O14926	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	FGFR4	P22455	802 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	PBX3	P40426	434 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	DNM2	P50570	870 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	FAM189B	P81408	668 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	PLCB3	Q01970	1234 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	NTRK3	Q16288	839 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	TMC7	Q7Z402	723 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	ZBTB33	Q86T24	672 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	FBXL16	Q8N461	479 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	RDM1	Q8NG50	284 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	GJA10	Q969M2	543 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	FBXL18	Q96ME1	805 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	CASD1	Q96PB1	797 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	APOL5	Q9BWW9	433 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	SPG21	Q9NZD8	308 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	DEXI	O95424	95 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	TDP2	O95551	362 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	NHLH1	Q02575	133 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685		Q4G0T1	1027 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	XKR3	Q5GH77	459 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	RUFY3	Q7L099	469 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685		A0A0U1RQF3	1178 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NOP16-208	ENST00000616685	HIDE1	A8MVS5	230 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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