RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 ZNF410Q86VK4 478 aa30.07■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 LINC01599Q8WXQ3 324 aa30.07■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 PPM1EQ8WY54 764 aa30.07■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 TUFT1Q9NNX1 390 aa30.07■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 ANKEF1Q9NU02 776 aa30.07■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa30.07■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 RFXAPO00287 272 aa30.06■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 DARSP14868 501 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 ADGRE1Q14246 886 aa30.06■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 HAUS3Q68CZ6 603 aa30.06■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 NLRP4Q96MN2 994 aa30.06■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 MTRQ99707 1265 aa30.06■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa30.06■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 LAD1O00515 517 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 PDCP20941 246 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 SARSP49591 514 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 PTGDRQ13258 359 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 CUL4AQ13619 759 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 EMC2Q15006 297 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 SLC24A5Q71RS6 500 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 MICALL1Q8N3F8 863 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 FBXO22Q8NEZ5 403 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 RGS18Q9NS28 235 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 STK24Q9Y6E0 443 aa30.05■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa30.04■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 A0A087WZ62 844 aa30.04■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 ZBTB39O15060 712 aa30.04■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.43e-7■■■□□ 17.5
BRD4-208ENST00000597315 TMEM143Q96AN5 459 aa30.04■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 SPRED2Q7Z698 418 aa30.03■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 PIGOQ8TEQ8 1089 aa30.03■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 NACC1Q96RE7 527 aa30.03■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 C17orf80Q9BSJ5 609 aa30.03■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa30.03■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 LRWD1Q9UFC0 647 aa30.03■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 RWDD3Q9Y3V2 267 aa30.03■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 EPOPA6NHQ4 379 aa30.02■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 ASAP2O43150 1006 aa30.02■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 MGEA5O60502 916 aa30.02■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 DGAT1O75907 488 aa30.02■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 DGKIO75912 1065 aa30.02■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP30.02■■■□□ 2.41e-12■■□□□ 11.5
BRD4-208ENST00000597315 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 CATSPER3Q86XQ3 398 aa30.02■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 TTC3P53804 2025 aa30.01■■■□□ 2.4
BRD4-208ENST00000597315 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 GRB10Q13322 594 aa30.01■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 KSR1Q8IVT5 923 aa30.01■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 GDPD5Q8WTR4 605 aa30.01■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 DACT1Q9NYF0 836 aa30.01■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 MED24O75448 989 aa30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 FGFR4P22455 802 aa30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 RPA1P27694 616 aa30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 PDIA5Q14554 519 aa30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 EPC2Q52LR7 807 aa30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 DTHD1Q6ZMT9 781 aa30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 TMEM192Q8IY95 271 aa30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 C4orf32Q8N8J7 132 aa30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 C9IYK1 514 aa29.99■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 PRPHP41219 470 aa29.99■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 RARRES1P49788 294 aa29.99■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa29.99■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 CATSPER4Q7RTX7 472 aa29.99■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 MUTP22033 750 aa29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 CTNNB1P35222 781 aa29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 TFDP1Q14186 410 aa29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 DSC3Q14574 896 aa29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 BRAPQ7Z569 592 aa29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 FERMT3Q86UX7 667 aa29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 CHST12Q9NRB3 414 aa29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 TMEM161AQ9NX61 479 aa29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 MTCH2Q9Y6C9 303 aa29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 COL4A6Q14031 1691 aa29.98■■■□□ 2.39
BRD4-208ENST00000597315 COL6A3P12111 3177 aa29.97■■■□□ 2.39
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