RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592759.5

POP4-213, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 4

Gene POP4, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP4-213	ENST00000592759	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	GBF1	Q92538	1859 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	RAD54L	Q92698	747 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	PANK2	Q9BZ23	570 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.94	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	PLA2G4B	P0C869	781 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	ACR	P10323	421 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	GPC3	P51654	580 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	FPGS	Q05932	587 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	MCM6	Q14566	821 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	LPIN1	Q14693	890 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	ADAL	Q6DHV7	355 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	CALML4	Q96GE6	196 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	MTR	Q99707	1265 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.93	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	GLRA2	P23416	452 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	CMA1	P23946	247 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	RFC2	P35250	354 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	IER5	Q5VY09	327 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	AKT3	Q9Y243	479 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.92	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	TTC3	P53804	2025 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759		A0A1W2PQ27	194 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759		A0A1W2PQ64	194 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759		A0A1W2PQD8	194 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	GABBR2	O75899	941 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	GHR	P10912	638 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	TMOD1	P28289	359 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	BMP8B	P34820	402 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	PDILT	Q8N807	584 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	MAP7D2	Q96T17	732 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	OSMR	Q99650	979 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		13.91	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759		A0A087WZ62	844 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759		A0A1B0GVL5	298 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	PFKFB1	P16118	471 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	GUCY2C	P25092	1073 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	DNM2	P50570	870 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	CAPS	Q13938	189 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	RASIP1	Q5U651	963 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	TCP11	Q8WWU5	503 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		13.9	□□□□□ -0.18
POP4-213	ENST00000592759	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.9	□□□□□ -0.18

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