RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 NLRP7Q8WX94 980 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 HPS3Q969F9 1004 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CALML4Q96GE6 196 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF302Q9NR11 478 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa6.74□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SFI1A8K8P3 1242 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RSPH10B2B2RC85 870 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MAFGO15525 162 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SEPT4O43236 478 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 KINO60870 393 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ATG7O95352 703 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 LGALS2P05162 132 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G4BP0C869 781 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RSPH10BP0C881 870 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RPA1P27694 616 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TXLNAP40222 546 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 JAK3P52333 1124 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 IGBP1P78318 339 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CUL4BQ13620 913 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PDIA5Q14554 519 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCB4Q15147 1175 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 XKR9Q5GH70 373 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DESI1Q6ICB0 168 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ANO5Q75V66 913 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DYMQ7RTS9 669 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GPBP1Q86WP2 473 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MEIOBQ8N635 442 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CNNM3Q8NE01 707 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RAD54LQ92698 747 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GLG1Q92896 1179 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PAGE5Q96GU1 130 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CDHR1Q96JP9 859 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 AK8Q96MA6 479 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB34Q9BZG1 259 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 NUP62CLQ9H1M0 184 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa6.73□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SYCE3A1L190 88 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MYMKA6NI61 221 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 LGR5O75473 907 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 MBD3O95983 291 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GNRH1P01148 92 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 TGFB3P10600 412 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL5P13501 91 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SFNP31947 248 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 STAT5BP51692 787 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMC5P62195 406 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 DRP2Q13474 957 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 LAMC2Q13753 1193 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 ARSHQ5FYA8 562 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GNASQ5JWF2 1037 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 HYIQ5T013 277 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 HAUS3Q68CZ6 603 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SV2AQ7L0J3 742 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CAPNS1-208ENST00000589162 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.72□□□□□ -1.33
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