RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD40Q6AI12 368 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 IFT74Q96LB3 600 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 STRA6Q9BX79 667 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 THAP9Q9H5L6 903 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SIP14410 1827 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM49BA6NDI0 452 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 H0YCG3 227 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R37O75864 691 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 NCKAP1LP55160 1127 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QTNF8P60827 252 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX3-2P78367 333 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP2R5AQ15172 486 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TCP11Q8WWU5 503 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 HVCN1Q96D96 273 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD10Q9H3F6 313 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GPRC5CQ9NQ84 441 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB42B2RXF5 422 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 KPNA6O60684 536 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 MYBP10242 640 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 NMT1P30419 496 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC173Q0VFZ6 552 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ZCWPW2Q504Y3 356 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNN1Q92952 543 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM5Q9C035 493 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 RNPEPQ9H4A4 650 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SPC25Q9HBM1 224 aa34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 K7ENM7 598 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PDXKO00764 312 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCY5O95622 1261 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF286BP0CG31 522 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX3P56589 373 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 GJA9P57773 515 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 EDRF1Q3B7T1 1238 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 IER5Q5VY09 327 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM114A1Q8IWE2 563 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEB2O15479 319 aa34.2■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 F2P00734 622 aa34.2■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL2P36404 184 aa34.2■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2BQ00403 316 aa34.2■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa34.2■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 SLAIN1Q8ND83 568 aa34.2■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa34.2■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 AP5Z1O43299 807 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 RARBP10826 455 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 CTAGE1Q96RT6 745 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 KATNAL1Q9BW62 490 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM206Q9H813 350 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 INSRRP14616 1297 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ELNP15502 786 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 NPTX2P47972 431 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 FANCCQ00597 558 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 HAUS6Q7Z4H7 955 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 NELFCDQ8IXH7 590 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 RETREG2Q8NC44 543 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 PDLIM2Q96JY6 352 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 KMT5AQ9NQR1 393 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 CBFA2T2O43439 604 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 CALUO43852 315 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP1A3P13637 1013 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 CNGA1P29973 690 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 NAMPTP43490 491 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA5Q8TBA6 731 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 FRMPD3Q5JV73 1810 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 RRN3P2A6NIE6 340 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXD13P35453 343 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 NFIL3Q16649 462 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 CEP63Q96MT8 703 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC169A6NNP5 214 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINC1P01008 464 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 DNM2P50570 870 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF75DP51815 510 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM32Q13049 653 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 ACCSQ96QU6 501 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R9BQ96SB3 815 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-206ENST00000588815 WBP1LQ9NX94 342 aa34.15■■■■□ 3.06
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