RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 RNF19AQ9NV58 838 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.85■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 FSCN2O14926 492 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 HOXA2O43364 376 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 GPC3P51654 580 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 NLRP5P59047 1200 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 LRRC43Q8N309 656 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 GJA10Q969M2 543 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 CASD1Q96PB1 797 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 LZTS1Q9Y250 596 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 TECTAO75443 2155 aa21.84■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 PLCB3Q01970 1234 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 ABI1Q8IZP0 508 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 TBCKQ8TEA7 893 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 SCLT1Q96NL6 688 aa21.83■■□□□ 1.09
TRAF4-216ENST00000586813 LOC730098B7Z3J9 87 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 RUFY3Q7L099 469 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 RDM1Q8NG50 284 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.82■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 PSMD10O75832 226 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 TDP2O95551 362 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 PPM1AP35813 382 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 Q4G0T1 1027 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 RNF169Q8NCN4 708 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 NLRP7Q8WX94 980 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 EDAQ92838 391 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF558Q96NG5 402 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 TCF25Q9BQ70 676 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 FGFR4P22455 802 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 PBX3P40426 434 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 DRP2Q13474 957 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 KCNC3Q14003 757 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 SUSD6Q92537 303 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 KCNH6Q9H252 994 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa21.8■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 A0A0U1RQF3 1178 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 M0R2N6 131 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 DEXIO95424 95 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 CYP3A7P24462 503 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 MTERF2Q49AM1 385 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 BLIDQ8IZY5 108 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 DACT1Q9NYF0 836 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM150BA6NC51 233 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 HIDE1A8MVS5 230 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 CPLX1O14810 134 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 NPY5RQ15761 445 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 XKR3Q5GH77 459 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 FBXL18Q96ME1 805 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 MBOAT7Q96N66 472 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 CEP89Q96ST8 783 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 SPG21Q9NZD8 308 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.78■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 STBD1O95210 358 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 EOMESO95936 686 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 KRT17Q04695 432 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD54Q6NXT1 300 aa21.77■■□□□ 1.08
TRAF4-216ENST00000586813 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms