RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-225	ENST00000585084	DNM2	P50570	870 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	CDC42EP1	Q00587	391 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	FAM20A	Q96MK3	541 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
GPS1-225	ENST00000585084	HOXA2	O43364	376 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	FGFR1	P11362	822 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	PSMC5	P62195	406 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	GJD3	Q8N144	294 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	CD320	Q9NPF0	282 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	MARCH6	O60337	910 aa		32	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	LTBR	P36941	435 aa		32	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		32	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM150B	A6NC51	233 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	DTNB	O60941	627 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	STBD1	O95210	358 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	CTDNEP1	O95476	244 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	31.99	■■■□□ 2.71	2e-9	■■□□□ 13.9
GPS1-225	ENST00000585084	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	OXER1	Q8TDS5	423 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	IRS1	P35568	1242 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	UBE3A	Q05086	875 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	PPP2R5C	Q13362	524 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	DRP2	Q13474	957 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	ABI1	Q8IZP0	508 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	EML1	O00423	815 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	LAG3	P18627	525 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	CEP89	Q96ST8	783 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	31.97	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	VAV3	Q9UKW4	847 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	TBX3	O15119	743 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	FGF18	O76093	207 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	FGFR4	P22455	802 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	ADAM15	Q13444	863 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	CLUL1	Q15846	466 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	ANO5	Q75V66	913 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	NECAB1	Q8N987	351 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	RNF169	Q8NCN4	708 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	DACT1	Q9NYF0	836 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	HCST	Q9UBK5	93 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	LINC01565	O15544	149 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	KRT2	P35908	639 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	NDUFV1	P49821	464 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	ME3	Q16798	604 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	CWH43	Q9H720	699 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-225	ENST00000585084	TBX10	O75333	385 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	NRIP1	P48552	1158 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	ZNF410	Q86VK4	478 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	GTF3C6	Q969F1	213 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	CASD1	Q96PB1	797 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	TLR9	Q9NR96	1032 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084		A0A087WZ62	844 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084		A0A0U1RQF3	1178 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	EOMES	O95936	686 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	NEK4	P51957	841 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	LRRC43	Q8N309	656 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	EFHB	Q8N7U6	833 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	HAS1	Q92839	578 aa		31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
GPS1-225	ENST00000585084	CHST12	Q9NRB3	414 aa		31.93	■■■□□ 2.7

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