RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583704.1

TTC19-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 2

Gene TTC19, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-210ENST00000583704 SEC24BO95487 1268 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 CYP3A7P24462 503 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 NRIP1P48552 1158 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 GPC3P51654 580 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 FAM189BP81408 668 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 SCLT1Q96NL6 688 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 CD207Q9UJ71 328 aa25.15■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 EFHBQ8N7U6 833 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 RDM1Q8NG50 284 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 ETNPPLQ8TBG4 499 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 CWH43Q9H720 699 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa25.14■■□□□ 1.62
TTC19-210ENST00000583704 TMEM150BA6NC51 233 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 C19orf67A6NJJ6 358 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 FGF18O76093 207 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 ALADP13716 330 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 UBE3AQ05086 875 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 DRP2Q13474 957 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 MTERF2Q49AM1 385 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 GALNT17Q6IS24 598 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 ZNF710Q8N1W2 664 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 NLRP7Q8WX94 980 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 MSLNLQ96KJ4 702 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 MBOAT7Q96N66 472 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 TLR9Q9NR96 1032 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 RNF19AQ9NV58 838 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 STK36Q9NRP7 1315 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 DARSP14868 501 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 FGFR4P22455 802 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 PLA2G5P39877 138 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 INF2Q27J81 1249 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 SH2D3AQ9BRG2 576 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 TMEM117Q9H0C3 514 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 CLEC1BQ9P126 229 aa25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 DCXO43602 365 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 SLC37A4O43826 429 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 DTNBO60941 627 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 GLP2RO95838 553 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 LAG3P18627 525 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 NEK4P51957 841 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 XKR3Q5GH77 459 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 CASD1Q96PB1 797 aa25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 HOXA2O43364 376 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 STBD1O95210 358 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 XBP1P17861 261 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 ERVFC1P60507 584 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 LETM2Q2VYF4 491 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 ECHDC2Q86YB7 292 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 NECAB1Q8N987 351 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 RNF169Q8NCN4 708 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 FAM122AQ96E09 287 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 CEP89Q96ST8 783 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 TLE6Q9H808 572 aa25.1■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 PER2O15055 1255 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 CTDNEP1O95476 244 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 EYA4O95677 639 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 ME3Q16798 604 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 ABI1Q8IZP0 508 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 LRRC43Q8N309 656 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 SMRP1Q8NCR6 262 aa25.09■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 PRR33A8MZF0 331 aa25.08■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 LARGE1O95461 756 aa25.08■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 PBX3P40426 434 aa25.08■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 CLLU1OSQ5K130 101 aa25.08■■□□□ 1.61
TTC19-210ENST00000583704 TRIOO75962 3097 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC19-210ENST00000583704 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC19-210ENST00000583704 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC19-210ENST00000583704 DDX11L8A8MPP1 907 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC19-210ENST00000583704 FSCN2O14926 492 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC19-210ENST00000583704 COASYQ13057 564 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC19-210ENST00000583704 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC19-210ENST00000583704 WASF1Q92558 559 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC19-210ENST00000583704 GTF3C6Q969F1 213 aa25.07■■□□□ 1.6
TTC19-210ENST00000583704 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms