RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346	SLC26A4	O43511	780 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	KRT86	O43790	486 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	RXRA	P19793	462 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	BMP6	P22004	513 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	VAMP1	P23763	118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	STAT6	P42226	847 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	NLRP5	P59047	1200 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	CHRND	Q07001	517 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	TROAP	Q12815	778 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	FIGN	Q5HY92	759 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	DPF2	Q92785	391 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	WNT8B	Q93098	351 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	HHIP	Q96QV1	700 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	CABP5	Q9NP86	173 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	COL6A3	P12111	3177 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346		A0A087WWV3	80 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	PSMD14	O00487	310 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	MAP2K7	O14733	419 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	PLSCR1	O15162	318 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	BAG3	O95817	575 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	GYPC	P04921	128 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	FST	P19883	344 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	LMNB1	P20700	586 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	EPHA1	P21709	976 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	GNA11	P29992	359 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	UBA7	P41226	1012 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	DNM2	P50570	870 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	CDK17	Q00537	523 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	ITIH3	Q06033	890 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	RBL2	Q08999	1139 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	SEPT2	Q15019	361 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	KRT31	Q15323	416 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	PKN1	Q16512	942 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	MEA1	Q16626	185 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	SUSD4	Q5VX71	490 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NSF-208	ENST00000576346	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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