RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576069.5

SPNS3-206, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 834 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-206ENST00000576069 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS3-206ENST00000576069 ERVK-5Q9HDB9 667 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS3-206ENST00000576069 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS3-206ENST00000576069 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SPNS3-206ENST00000576069 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.58■■□□□ 1.05
SPNS3-206ENST00000576069 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 ENPP3O14638 875 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 NASPP49321 788 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 PKP1Q13835 747 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 RAB30Q15771 203 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 ATL3Q6DD88 541 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 SCLT1Q96NL6 688 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 PBX4Q9BYU1 374 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 MSRAQ9UJ68 235 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.57■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 EYA4O95677 639 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 ARL2P36404 184 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 UBA7P41226 1012 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 DEFB103AP81534 67 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 PADI6Q6TGC4 694 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 CABP7Q86V35 215 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 FAM228AQ86W67 206 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 TOP1MTQ969P6 601 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 SZT2Q5T011 3432 aa21.56■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 SIP14410 1827 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 TMEM265A0A087WTH1 108 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 A0A087WZ62 844 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 BRD1O95696 1058 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 CYP11B2P19099 503 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 DNAJB2P25686 324 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 GRIN1Q05586 938 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 POU5F1BQ06416 359 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 KSR1Q8IVT5 923 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 TMX1Q9H3N1 280 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 E9PMD0 336 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 GJB5O95377 273 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 PBX2P40425 430 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 RABGGTBP53611 331 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 GRB10Q13322 594 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 MYOCDQ8IZQ8 938 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 CALML4Q96GE6 196 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 NLRP4Q96MN2 994 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 PNMA5Q96PV4 448 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 YEATS4O95619 227 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 TFDP1Q14186 410 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 STK38Q15208 465 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 TMEM119Q4V9L6 283 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 TIFAQ96CG3 184 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 RAD9AQ99638 391 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 CSRNP2Q9H175 543 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 SPTLC2O15270 562 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 TLL1O43897 1013 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 PPP6R2O75170 966 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 KCNK18Q7Z418 384 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 RNF149Q8NC42 400 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 LINC01599Q8WXQ3 324 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 RGS18Q9NS28 235 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 CFAP45Q9UL16 551 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-206ENST00000576069 DENND3A2RUS2 1198 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS3-206ENST00000576069 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
SPNS3-206ENST00000576069 GLRA2P23416 452 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS3-206ENST00000576069 PHKA2P46019 1235 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS3-206ENST00000576069 PTENP60484 403 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS3-206ENST00000576069 DSC3Q14574 896 aa21.51■■□□□ 1.03
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