RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 LYPLA2O95372 231 aa19.13■□□□□ 0.65
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CCNDBP1-211ENST00000567434 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP19.13■□□□□ 0.65
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CCNDBP1-211ENST00000567434 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP1R16BQ96T49 567 aa19.13■□□□□ 0.65
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CCNDBP1-211ENST00000567434 XKR9Q5GH70 373 aa19.09■□□□□ 0.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHPN2Q8IUC4 686 aa19.09■□□□□ 0.65
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CCNDBP1-211ENST00000567434 AAK1Q2M2I8 961 aa19.08■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 TIGD5Q53EQ6 642 aa19.08■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 RSPH1Q8WYR4 309 aa19.08■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 P2RX5Q93086 422 aa19.08■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa19.08■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARID2Q68CP9 1835 aa19.08■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 POTEMA6NI47 508 aa19.07■□□□□ 0.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAD1O00515 517 aa19.07■□□□□ 0.64
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