RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC172P0C7W6 258 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LMNB1P20700 586 aa23.27■■□□□ 1.32
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.27■■□□□ 1.32
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STK33Q9BYT3 514 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMTNP53814 917 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NCKAP1LP55160 1127 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CETN1Q12798 172 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GNPTABQ3T906 1256 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.26■■□□□ 1.31
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 P4HA2O15460 535 aa23.26■■□□□ 1.31
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSAPP07602 524 aa23.26■■□□□ 1.31
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF14Q9UBS8 474 aa23.26■■□□□ 1.31
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