RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	PDILT	Q8N807	584 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	IL23A	Q9NPF7	189 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		11.29	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A087WZ62	844 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A087X0B3	334 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	LCHN	A4D1U4	455 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	MGEA5	O60502	916 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	FGB	P02675	491 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	LIG1	P18858	919 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	GATM	P50440	423 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	MGAT3	Q09327	533 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	BFSP2	Q13515	415 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	XKR3	Q5GH77	459 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	SCLT1	Q96NL6	688 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	PNMA5	Q96PV4	448 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	GPR32	O75388	356 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	GNAT1	P11488	350 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	TRAPPC10	P48553	1259 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	RARRES1	P49788	294 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	HCST	Q9UBK5	93 aa		11.28	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	ARID2	Q68CP9	1835 aa		11.27	□□□□□ -0.6
FAM227B-208	ENST00000559573	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	GRB10	Q13322	594 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CAGE1	Q8TC20	777 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CASP1	P29466	404 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF445	P59923	1031 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	TMX1	Q9H3N1	280 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PADI3	Q9ULW8	664 aa		11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RFXAP	O00287	272 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC26A2	P50443	739 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	EMC2	Q15006	297 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	C4orf19	Q8IY42	314 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	CAPN2	P17655	700 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RPA1	P27694	616 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	GPC3	P51654	580 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	STK38	Q15208	465 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM228A	Q86W67	206 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PBX4	Q9BYU1	374 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	BRD1	O95696	1058 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	EDN1	P05305	212 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	PLCG1	P19174	1290 aa		11.25	□□□□□ -0.61
FAM227B-208	ENST00000559573	MCM6	Q14566	821 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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