RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.93□□□□□ -1.62
TMOD3-202ENST00000558300 ODR4Q5SWX8 454 aa4.93□□□□□ -1.62
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TMOD3-202ENST00000558300 MRGPREQ86SM8 312 aa4.93□□□□□ -1.62
TMOD3-202ENST00000558300 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.93□□□□□ -1.62
TMOD3-202ENST00000558300 D2HGDHQ8N465 521 aa4.93□□□□□ -1.62
TMOD3-202ENST00000558300 DCAF4Q8WV16 495 aa4.93□□□□□ -1.62
TMOD3-202ENST00000558300 JDP2Q8WYK2 163 aa4.93□□□□□ -1.62
TMOD3-202ENST00000558300 C8orf48Q96LL4 319 aa4.93□□□□□ -1.62
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TMOD3-202ENST00000558300 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-202ENST00000558300 PDE8AO60658 829 aa4.92□□□□□ -1.62
TMOD3-202ENST00000558300 NPTXRO95502 500 aa4.92□□□□□ -1.62
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TMOD3-202ENST00000558300 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
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TMOD3-202ENST00000558300 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
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TMOD3-202ENST00000558300 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
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TMOD3-202ENST00000558300 WNT9AO14904 365 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD3-202ENST00000558300 FGFR1P11362 822 aa4.91□□□□□ -1.62
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TMOD3-202ENST00000558300 BTBD8Q5XKL5 378 aa4.89□□□□□ -1.63
TMOD3-202ENST00000558300 KCNT2Q6UVM3 1135 aa4.89□□□□□ -1.63
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