RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556262.5

SDR39U1-218, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SDR39U1, Length 1,960 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SDR39U1-218ENST00000556262 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.47■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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SDR39U1-218ENST00000556262 EPHB6O15197 1021 aa20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 GTF2BQ00403 316 aa20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 GRB14Q14449 540 aa20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 TTLL4Q14679 1199 aa20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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SDR39U1-218ENST00000556262 KIFAP3Q92845 792 aa20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 CCDC51Q96ER9 411 aa20.46■□□□□ 0.87
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SDR39U1-218ENST00000556262 PASKQ96RG2 1323 aa20.46■□□□□ 0.87
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SDR39U1-218ENST00000556262 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 SCFD2Q8WU76 684 aa20.46■□□□□ 0.87
SDR39U1-218ENST00000556262 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.46■□□□□ 0.87
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SDR39U1-218ENST00000556262 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.45■□□□□ 0.86
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SDR39U1-218ENST00000556262 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 RETREG2Q8NC44 543 aa20.45■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 TSC1Q92574 1164 aa20.45■□□□□ 0.86
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SDR39U1-218ENST00000556262 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.45■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 AZI2Q9H6S1 392 aa20.45■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 TMEM206Q9H813 350 aa20.45■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.45■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa20.44■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 FECHP22830 423 aa20.44■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.44■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.44■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.44■□□□□ 0.86
SDR39U1-218ENST00000556262 BORCS6Q96GS4 357 aa20.44■□□□□ 0.86
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