RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552440.5

USP44-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, human

TSL 5 BASIC

Gene USP44, Length 1,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP44-208	ENST00000552440	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	NTRK3	Q16288	839 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PRR16	Q569H4	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	VWCE	Q96DN2	955 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.9	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PSPN	O60542	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	PLOD3	O60568	738 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	IL33	O95760	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	MPO	P05164	745 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SYN1	P17600	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	IGFALS	P35858	605 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SCNN1B	P51168	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	GFRA1	P56159	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	BTK	Q06187	659 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ODF1	Q14990	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SHISA4	Q96DD7	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	EYA2	O00167	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ZBED1	O96006	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ITGA4	P13612	1032 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	FLT3	P36888	993 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	KRT83	P78385	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	KRT85	P78386	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	MAP4K2	Q12851	820 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	NFIX	Q14938	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CFAP100	Q494V2	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	BRF1	Q92994	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	N4BP3	O15049	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	INMT	O95050	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	KCNH1	O95259	989 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	HOXD12	P35452	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	KRT20	P35900	424 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	TDO2	P48775	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ZNF131	P52739	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	ZNF445	P59923	1031 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	TERF2	Q15554	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
USP44-208	ENST00000552440	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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