RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 IL17BQ9UHF5 180 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SCG2P13521 617 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 PPM1AP35813 382 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SATB1Q01826 763 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 CTR9Q6PD62 1173 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 PCSK4Q6UW60 755 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 PPTC7Q8NI37 304 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 OSBP2Q969R2 916 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 HCSTQ9UBK5 93 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 LNP1A1A4G5 178 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 B4DLN1 442 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 GPAA1O43292 621 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 GNAT1P11488 350 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 CA8P35219 290 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 LAMC2Q13753 1193 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 GIT2Q14161 759 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 WTAPQ15007 396 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SPG21Q9NZD8 308 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 NYAP2Q9P242 653 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 IRAK3Q9Y616 596 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 CLUHO75153 1309 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 LAMA1P25391 3075 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SPAG17Q6Q759 2223 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 K7ESF4 209 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 M0R2C6 588 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SLC28A2O43868 658 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 GNAT2P19087 354 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 MGAT3Q09327 533 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SBK1Q52WX2 424 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 TTC22Q5TAA0 569 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 KBTBD6Q86V97 674 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 FGF14Q92915 247 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 C2CD2LO14523 706 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 RASA1P20936 1047 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 HOXA6P31267 233 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 CD52P31358 61 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 PARM1Q6UWI2 310 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 DNERQ8NFT8 737 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 GAB3Q8WWW8 586 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 RILPL2Q969X0 211 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 ZNF558Q96NG5 402 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 MKNK2Q9HBH9 465 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-225ENST00000551253 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms