RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	HLA-C	Q95604	372 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	MTMR9	Q96QG7	549 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		12.88	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	DENND3	A2RUS2	1198 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	BMP1	P13497	986 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	DRP2	Q13474	957 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	RABEP1	Q15276	862 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ZNF410	Q86VK4	478 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	NEK9	Q8TD19	979 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	CHST12	Q9NRB3	414 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		12.87	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	TMEM150B	A6NC51	233 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	WNT7A	O00755	349 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	MARCH6	O60337	910 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	NEMF	O60524	1076 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	SLITRK3	O94933	977 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	CTNNB1	P35222	781 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	RFC5	P40937	340 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	CALCRL	Q16602	461 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	C8orf76	Q96K31	380 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	LXN	Q9BS40	222 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137		A0A0U1RQF3	1178 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	HOXA2	O43364	376 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	NCK2	O43639	380 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	EOMES	O95936	686 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	TRAPPC10	P48553	1259 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	NPEPPS	P55786	919 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	TFF2	Q03403	129 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ATP6V0A4	Q9HBG4	840 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	DACT1	Q9NYF0	836 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	RGL1	Q9NZL6	768 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		12.85	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137		A0A087WZ62	844 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	GRM6	O15303	877 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ASAP2	O43150	1006 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ST18	O60284	1047 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	CAMK1	Q14012	370 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	NLRP7	Q8WX94	980 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	DYDC2	Q96IM9	177 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	CEP170P1	Q96L14	293 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	RNF19A	Q9NV58	838 aa		12.84	□□□□□ -0.35
CS-223	ENST00000551137	ZNF623	O75123	536 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	ITGB1	P05556	798 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	TXK	P42681	527 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	GATM	P50440	423 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	UBE3A	Q05086	875 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	POU5F1B	Q06416	359 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36	6e-13	■□□□□ 9.5
CS-223	ENST00000551137	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CS-223	ENST00000551137	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		12.83	□□□□□ -0.36

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