RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 KSR1Q8IVT5 923 aa23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 TTC28Q96AY4 2481 aa23.36■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 C9IYK1 514 aa23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 LYPLA2O95372 231 aa23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 OR52Z1P0C646 297 aa23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 TRAPPC10P48553 1259 aa23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 NLRP7Q8WX94 980 aa23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 RGS18Q9NS28 235 aa23.35■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 A0A087WWV3 80 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 SARSP49591 514 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 EPC2Q52LR7 807 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 XKR9Q5GH70 373 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 TMEM143Q96AN5 459 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 SCLT1Q96NL6 688 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 A0A087WZ62 844 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 DENND3A2RUS2 1198 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 TECP42680 631 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 DNM2P50570 870 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 EMC2Q15006 297 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 TMEM192Q8IY95 271 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 FBXO22Q8NEZ5 403 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 NEK9Q8TD19 979 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 KIF3AQ9Y496 699 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 PPME1Q9Y570 386 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-222ENST00000550996 MED24O75448 989 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 RFC5P40937 340 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 FAM189BP81408 668 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 CUL4AQ13619 759 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 ODR4Q5SWX8 454 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 FIBCD1Q8N539 461 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 PIGOQ8TEQ8 1089 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.32■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 MCTP1Q6DN14 999 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 ZNF410Q86VK4 478 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 NLRP4Q96MN2 994 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 STAG3L1P0CL83 205 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 RARRES1P49788 294 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 SAMD11Q96NU1 681 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 RNF19AQ9NV58 838 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 CDC42EP1Q00587 391 aa23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 PTGDRQ13258 359 aa23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 IL17AQ16552 155 aa23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 POTEGQ6S5H5 508 aa23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.29■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 MYO7AQ13402 2215 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 H3BNC9 293 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 FGFR1P11362 822 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 CTNNB1P35222 781 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 BMPR1AP36894 532 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 ECM1Q16610 540 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 FERMT3Q86UX7 667 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 HCSTQ9UBK5 93 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 LRFN2Q9ULH4 789 aa23.28■■□□□ 1.32
CS-222ENST00000550996 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.27■■□□□ 1.32
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