RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 TRIM49CP0CI26 452 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ICAM3P32942 547 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 KCNMA1Q12791 1236 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 METTL7BQ6UX53 244 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ARMCX2Q7L311 632 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 NUP58Q9BVL2 599 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DGAT1O75907 488 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SLC9A1P19634 815 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 FKBP1BP68106 108 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 WDR59Q6PJI9 974 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 BICD1Q96G01 975 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 LRRIQ4A6NIV6 560 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 LRRC53A6NM62 1247 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 STBD1O95210 358 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 OATP04181 439 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TGFB3P10600 412 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 GNG11P61952 73 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZBED6P86452 979 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CYP27A1Q02318 531 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SAAL1Q96ER3 474 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CCDC51Q96ER9 411 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ACCSQ96QU6 501 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PCYT2Q99447 389 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.23□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 UQCRHP07919 91 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 EMC2Q15006 297 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 EXOC3L4Q17RC7 722 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 GPR142Q7Z601 462 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 RETREG2Q8NC44 543 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 KIF18AQ8NI77 898 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 SLC35C1Q96A29 364 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DNAJC7Q99615 494 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DEF6Q9H4E7 631 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PTPRFP10586 1907 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PARP14Q460N5 1801 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PPP1R37O75864 691 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CNGA1P29973 690 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 COPB2P35606 906 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ADCYAP1R1P41586 468 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 IGBP1P78318 339 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DRP2Q13474 957 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TTLL4Q14679 1199 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 KIFAP3Q92845 792 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 IFT74Q96LB3 600 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TMEM206Q9H813 350 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 FAM184BQ9ULE4 1060 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TRPC6Q9Y210 931 aa9.22□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.938e-7■■□□□ 12.3
CS-215ENST00000549143 NDUFA10O95299 355 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 DLG4P78352 724 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CHADLQ6NUI6 762 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 GJB7Q6PEY0 223 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 ANKRD23Q86SG2 305 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 CCDC42Q96M95 316 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.21□□□□□ -0.93
CS-215ENST00000549143 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms