RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529667.1

SOX9-AS1-208, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 340 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-208ENST00000529667 POTEJP0CG39 1038 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DPEP1P16444 411 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ICAM3P32942 547 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SOX5P35711 763 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DRG2P55039 364 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NCKAP1LP55160 1127 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CBX1P83916 185 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GOLGA8FQ08AF8 430 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 BFSP1Q12934 665 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PAK2Q13177 524 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MTMR3Q13615 1198 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SURF1Q15526 300 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CFAP58Q5T655 872 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RNF207Q6ZRF8 634 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CREG2Q8IUH2 290 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MREGQ8N565 214 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COG1Q8WTW3 980 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CAVIN3Q969G5 261 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LRRC45Q96CN5 670 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DYDC2Q96IM9 177 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IFT74Q96LB3 600 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ARID3AQ99856 593 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 STIM2Q9P246 746 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NAGPAQ9UK23 515 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 COQ4Q9Y3A0 265 aa7.36□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ASTN1O14525 1302 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 VWA5AO00534 786 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RPS6KA5O75582 802 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 AKAP3O75969 853 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MTA2O94776 668 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SLC25A27O95847 323 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MYBL1P10243 752 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 YWHABP31946 246 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MAN1A1P33908 653 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RFC5P40937 340 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ECE1P42892 770 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RARRES1P49788 294 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDR1P51861 262 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CACNB3P54284 484 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MFAP3P55082 362 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 GRM1Q13255 1194 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CASP8Q14790 479 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 KIF22Q14807 665 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LRRC41Q15345 812 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 XKR3Q5GH77 459 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MSL1Q68DK7 614 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CCDC174Q6PII3 467 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LBX2Q6XYB7 198 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 NELFCDQ8IXH7 590 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UBL4BQ8N7F7 174 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ACER1Q8TDN7 264 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CLEC4DQ8WXI8 215 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RFFLQ8WZ73 363 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 FAM167AQ96KS9 214 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TEPSINQ96N21 525 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RUFY1Q96T51 708 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 RMDN3Q96TC7 470 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 TEX13BQ9BXU2 312 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 CARD9Q9H257 536 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ACAD9Q9H845 621 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 PXMP2Q9NR77 195 aa7.35□□□□□ -1.23
SOX9-AS1-208ENST00000529667 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms