RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 BRCA2P51587 3418 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF862O60290 1169 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 FTCDO95954 541 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 OSTNP61366 133 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 PPM1KQ8N3J5 372 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 CEP63Q96MT8 703 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 EFCC1Q9HA90 598 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 ACP6Q9NPH0 428 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 PLAGL2Q9UPG8 496 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 A0A087X0T9 212 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 PLA2G6O60733 806 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 FAM228BP0C875 321 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 UCHL3P15374 230 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 ARHGAP25P42331 645 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 OTUD6AQ7L8S5 288 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 RETREG2Q8NC44 543 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 COPS5Q92905 334 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 TXNRD2Q9NNW7 524 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 RGS20O76081 388 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 PRKCEQ02156 737 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 KCTD2Q14681 263 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 CBWD6Q4V339 395 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 CBWD3Q5JTY5 395 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 CBWD5Q5RIA9 395 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 SPATC1LQ9H0A9 340 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 STK24Q9Y6E0 443 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 FOCADQ5VW36 1801 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 GGPS1O95749 300 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 CALCAP01258 141 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 PON1P27169 355 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 KRT76Q01546 638 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 CCDC181Q5TID7 509 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 CBWD2Q8IUF1 395 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 MYO6Q9UM54 1294 aa12.83□□□□□ -0.35
PTPRK-216ENST00000524481 PSAPP07602 524 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 ACOT2P49753 483 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 PDXDC1Q6P996 788 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 LRRC71Q8N4P6 559 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 ATP6V0A1Q93050 837 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 FAM213AQ9BRX8 229 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 EMSYQ7Z589 1322 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 NOL4O94818 638 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 KCNJ6P48051 423 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 PTK2Q05397 1052 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 EDRF1Q3B7T1 1238 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 ZBTB33Q86T24 672 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 SLC35C1Q96A29 364 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 PI4K2AQ9BTU6 479 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 TTYH3Q9C0H2 523 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 PDCL3Q9H2J4 239 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 CTAGE15A4D2H0 777 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 ANKRD63C9JTQ0 380 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 CTIFO43310 598 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 TLR2O60603 784 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 TACC1O75410 805 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 CTAGE8P0CG41 777 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 NPTX2P47972 431 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 CDR1P51861 262 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 SEMA3FQ13275 785 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 CTAGE6Q86UF2 777 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 CTAGE4Q8IX94 777 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 IFT74Q96LB3 600 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF112Q9UJU3 913 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 GJB1P08034 283 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 TNNI1P19237 187 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 CNGA1P29973 690 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 BIRC3Q13489 604 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 BAP1Q92560 729 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 ACCSQ96QU6 501 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 CDC23Q9UJX2 597 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 FAM184BQ9ULE4 1060 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 SAR1BQ9Y6B6 198 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 PLS3P13797 630 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP12.81□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 27.7
PTPRK-216ENST00000524481 JAK3P52333 1124 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 MYL7Q01449 175 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 MAPK7Q13164 816 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 EPC2Q52LR7 807 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 NFRKBQ6P4R8 1299 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRK-216ENST00000524481 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms