RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		10.66	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	MYO7A	Q13402	2215 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	DGKI	O75912	1065 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	OR52Z1	P0C646	297 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	TMOD1	P28289	359 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	MCM2	P49736	904 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	CUL4A	Q13619	759 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	IL17A	Q16552	155 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	ECM1	Q16610	540 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	XKR9	Q5GH70	373 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	MCTP1	Q6DN14	999 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	ADAM2	Q99965	735 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		10.65	□□□□□ -0.7
PABPC1-222	ENST00000523555	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	MUC3A	Q02505	3323 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555		C9IYK1	514 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	RARRES1	P49788	294 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	PTGDR	Q13258	359 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	EMC2	Q15006	297 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	EPC2	Q52LR7	807 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	POTEG	Q6S5H5	508 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	NLRP4	Q96MN2	994 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	RGS18	Q9NS28	235 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	RNF19A	Q9NV58	838 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	MYH11	P35749	1972 aa		10.64	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	PP2D1	A8MPX8	630 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	GPR182	O15218	404 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	LYPLA2	O95372	231 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	FGFR1	P11362	822 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	TRAPPC10	P48553	1259 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	NEK9	Q8TD19	979 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	SCLT1	Q96NL6	688 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	DENND3	A2RUS2	1198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555		H3BQV1	296 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	CDC25A	P30304	524 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	RFC5	P40937	340 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	FERMT3	Q86UX7	667 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM192	Q8IY95	271 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	FIBCD1	Q8N539	461 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	IL27	Q8NEV9	243 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	MTR	Q99707	1265 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	POLD4	Q9HCU8	107 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	CSPG5	O95196	566 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	RPA1	P27694	616 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	CTNNB1	P35222	781 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PABPC1-222	ENST00000523555	DNM2	P50570	870 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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