RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT85P78386 507 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 DGKDQ16760 1214 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 UGT8Q16880 541 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF827Q17R98 1081 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 VMACQ2NL98 169 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHG6Q3KR16 790 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 CT83Q5H943 113 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 MCTP2Q6DN12 878 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 SIAH1Q8IUQ4 282 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 REXO1L1PQ8IX06 675 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHL36Q8N4N3 616 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAX2Q96IS3 184 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAXDC2Q96IV6 333 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 SOX7Q9BT81 388 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 OSBPL6Q9BZF3 934 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC13A1Q9BZW2 595 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM168Q9H0V1 697 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTG2Q9H4K7 406 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRSS50Q9UI38 385 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 WASHC2AQ641Q2 1341 aa3.67□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 SHTN1A0MZ66 631 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 NOBOXO60393 691 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 CFBP00751 764 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLEC2LP0C7M8 214 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADCY8P40145 1251 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTNR1BP49286 362 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAP3K12Q12852 859 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC178Q5BJE1 867 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC62Q6P9F0 684 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR5AN1Q8NGI8 311 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTMR8Q96EF0 704 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 VWA7Q9Y334 891 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa3.66□□□□□ -1.82
RNU6-377P-201ENST00000515965 MROH6A6NGR9 719 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHGA12O60330 932 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALDH1L1O75891 902 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDH8O95206 1070 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CELA3BP08861 270 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CSF2RBP32927 897 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 IARSP41252 1262 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNC1P48547 511 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 LGALS4P56470 323 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIAA2012Q0VF49 1180 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PGM2L1Q6PCE3 622 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 OTOP2Q7RTS6 562 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDYL2Q8N8U2 506 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR14C36Q8NHC7 312 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 GAB3Q8WWW8 586 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SSH1Q8WYL5 1049 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 FERMT2Q96AC1 680 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 DYDC2Q96IM9 177 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEP89Q96ST8 783 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CARD11Q9BXL7 1154 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCTD10Q9H3F6 313 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa3.65□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM13O60858 407 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 LPLP06858 475 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYBL2P10244 700 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTHFD2P13995 350 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 AGXTP21549 392 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNQ1P51787 676 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 NEK2P51955 445 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 MCL1Q07820 350 aa3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP10Q14694 798 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCOLCEQ15113 449 aa3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms