RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 DSC3Q14574 896 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS10Q9H324 1103 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF862O60290 1169 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 STK3Q13188 491 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 XKR3Q5GH77 459 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF169Q8NCN4 708 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DACT1Q9NYF0 836 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PER2O15055 1255 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 EYA4O95677 639 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 XBP1P17861 261 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 GPC3P51654 580 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 COASYQ13057 564 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 LZTS1Q9Y250 596 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PSMD10O75832 226 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CDKL5O76039 1030 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP3A7P24462 503 aa21.67■■□□□ 1.06
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SH3BP2-220ENST00000511663 UGCGQ16739 394 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MTERF2Q49AM1 385 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC43Q8N309 656 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 GJA10Q969M2 543 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF558Q96NG5 402 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CASD1Q96PB1 797 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CWH43Q9H720 699 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CLEC1BQ9P126 229 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 EDIL3O43854 480 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 TDP2O95551 362 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 EOMESO95936 686 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 ERVFC1P60507 584 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PLCB3Q01970 1234 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF135Q8IUD6 432 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SMRP1Q8NCR6 262 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CHST12Q9NRB3 414 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0U1RQF3 1178 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 MARCH6O60337 910 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.068e-8■■■■■ 47.8
SH3BP2-220ENST00000511663 TCF25Q9BQ70 676 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SPG21Q9NZD8 308 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SH3BP2-220ENST00000511663 SKIP12755 728 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PSMC5P62195 406 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 DUSP6Q16828 381 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 LETM2Q2VYF4 491 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 TMC7Q7Z402 723 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 HCSTQ9UBK5 93 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 GLP2RO95838 553 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 FGFR4P22455 802 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 INF2Q27J81 1249 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 EXOC8Q8IYI6 725 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A087WZ62 844 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 M0R2N6 131 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 FSCN2O14926 492 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP2-220ENST00000511663 NEFLP07196 543 aa21.62■■□□□ 1.05
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