RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 CYP4A11Q02928 519 aa12.28□□□□□ -0.44
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CD27-AS1-204ENST00000504270 RSPH10B2B2RC85 870 aa12.24□□□□□ -0.45
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